Journal of Zhejiang University

Current Issue: <JZUS-B>

Journal of Zhejiang University-SCIENCE B (Biomedicine & Biotechnology)

ISSNs 1673-1581 (Print); 1862-1783 (Online); CN 33-1356/Q; started in 2005,Monthly.

JZUS-B is an international "Biomedicine & Biotechnology" reviewed-Journal indexed by SCI-E, MEDLINE, PMC, BA, BIOSIS Previews, JST, ZR, CA, SA, AJ, ZM, CABI, CSA, etc., and supported by the National Natural Science Foundation of China. It mainly covers research in Biomedicine, Biochemistry and Biotechnology, etc.

Impact factor: 1.099 (2011), 1.108 (2012), 1.293 (2013), 1.278 (2014), 1.303 (2015), 1.676 (2016), 1.815 (2017), 1.879 (2018).

Journal of Zhejiang University SCIENCE B

ISSN 1673-1581(Print), 1862-1783(Online), Monthly

2023 Vol.24 No.9 P.755-852

Cover:

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Contents:

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<<< CONTENTS >>>

Reviews

Review: Current insights on rice (Oryza sativa L.) bakanae disease and exploration of its management strategies

Chinnannan KARTHIK, Qingyao SHU

DOI: 10.1631/jzus.B2300085 Downloaded: 407 Clicked: 453 Cited: 0 Commented: 0(p.755-778) <Full Text> <PPT> 122

Chinese summary <7> 水稻惡苗病及其防治策略之洞察

Chinnannan KARTHIK^1,2，舒慶堯^1,3
¹浙江大(dà)學海南(nán)研究院，崖州灣科技城，中(zhōng)國三亞市， 572025
²西弗吉尼亞州立大(dà)學格斯·道格拉斯研究所與生(shēng)物(wù)學系，美國因斯提圖特市， WV 25112
³浙江大(dà)學現代種業研究所/水稻生(shēng)物(wù)育種全國重點實驗室，中(zhōng)國杭州市， 310058
摘要：惡苗病是由種傳或土傳藤倉鐮孢菌（Fusarium fujikuroi）引起的一(yī)種水稻的新興病害，正日益威脅着世界不同産區水稻的可持續生(shēng)産。惡苗病發病率因地區和品種而異，造成的産量損失可達3%~95%。認識惡苗病病原菌的特性、緻病性、病害流行學、病害症狀、寄主-病原菌互作以及病害發生(shēng)周期中(zhōng)次生(shēng)代謝物(wù)的作用，将有助于制定高效、可持續的病害防治策略，但迄今仍缺乏對水稻惡苗病全面和詳細的描述。爲此，本篇綜述對1898至2023年間惡苗病各關鍵領域的研究進行總結和深入探讨，并對今後研究提出展望。

關鍵詞組：水稻；惡苗病；藤倉鐮孢菌；寄主-病原菌互作；緻病性；赤黴素信号傳導；病害治理

Review: Detection and quantitative analysis of tumor-associated tertiary lymphoid structures

Man YANG, Yurou CHE, Kezhen LI, Zengyi FANG, Simin LI, Mei WANG, Yiyao ZHANG, Zhu XU, Liping LUO, Chuan WU, Xin LAI, Weidong WANG

DOI: 10.1631/jzus.B2200605 Downloaded: 442 Clicked: 571 Cited: 0 Commented: 0(p.779-795) <Full Text> <PPT> 108

Chinese summary <7> 腫瘤相關的三級淋巴結構的檢測和量化分(fēn)析

楊曼^1,2，車(chē)雨柔^1,2，李柯臻^1,3，方曾怡^1,2，李思敏^1,3，王梅^1,2，張藝耀^1,2，徐祝^1,3，羅麗萍^1,2，吳川^1,2，賴昕^1,2，王衛東^1,2,3
¹電子科技大(dà)學附屬腫瘤醫院，放(fàng)射腫瘤學四川省重點實驗室，四川省腫瘤臨床醫學研究中(zhōng)心，四川省腫瘤醫院放(fàng)療科，中(zhōng)國成都市，610000
²電子科技大(dà)學醫學院，中(zhōng)國成都市，610000
³西南(nán)醫科大(dà)學臨床醫學院腫瘤科，中(zhōng)國泸州市，646000
摘要：腫瘤相關的三級淋巴結構（TLS），主要由B細胞和T細胞群體(tǐ)有機聚集形成于腫瘤組織範圍内的異位淋巴組織。在腫瘤中(zhōng)，TLS的存在與免疫治療的反應性和腫瘤預後密切相關。因其具有廣闊的臨床應用前景，研究者一(yī)直在積極探索。許多研究都試圖破譯TLS的形成機制、結構組成、誘導生(shēng)成、預測标記物(wù)和臨床利用。與此同時，用科學的方法定性和定量描述TLS，對其研究至關重要。在檢測方面，蘇木精-伊紅染色法（H&E）染色、多重免疫組化、多重免疫熒光和12趨化因子基因特征是被認可的方法。然而在TLS的定量分(fēn)析方面，例如TLS的絕對計數、組成TLS的細胞分(fēn)析、TLS的結構特征、空間位置、密度、成熟度等，目前尚無标準方法。本研究回顧了TLS檢測和定量分(fēn)析的最新研究進展，提出了TLS評估的新方向，并解決了TLS在臨床上的定量應用問題。

關鍵詞組：三級淋巴結構（TLS）；腫瘤微環境；趨化因子特征；空間轉錄組學；人工(gōng)智能；影像組學

Review: OCT4’s role and mechanism underlying oral squamous cell carcinoma

Yuwei DAI, Ziqiong WU, Yitong CHEN, Xinjian YE, Chaowei WANG, Huiyong ZHU

DOI: 10.1631/jzus.B2200602 Downloaded: 468 Clicked: 607 Cited: 0 Commented: 0(p.796-806) <Full Text> <PPT> 123

Chinese summary <7> OCT4在口腔鱗狀細胞癌發病機制中(zhōng)的作用

戴雨薇^1,2，吳紫瓊³，陳怡彤³，葉鑫健⁴，王超炜¹，朱慧勇¹
¹浙江大(dà)學醫學院第一(yī)附屬醫院口腔颌面外(wài)科，中(zhōng)國杭州市，310003
²浙江大(dà)學醫學院，中(zhōng)國杭州市，310058
³浙江中(zhōng)醫藥大(dà)學口腔醫學院，中(zhōng)國杭州市，310053
⁴浙江大(dà)學醫學院附屬口腔醫院，浙江大(dà)學口腔醫學院，浙江省口腔疾病臨床醫學研究中(zhōng)心，浙江省口腔生(shēng)物(wù)醫學研究重點實驗室，浙江大(dà)學癌症研究院，中(zhōng)國杭州市，310006
摘要：口腔鱗狀細胞癌（OSCC）是一(yī)種常見的頭頸部惡性腫瘤。由于腫瘤複發率高、頸部淋巴結轉移和缺乏有效的全身治療手段，OSCC在全球最具負面影響的癌症中(zhōng)排名第六。其預後差，死亡率高。八聚體(tǐ)結合轉錄因子4（OCT4）是Pit-Oct-Unc（POU）家族的成員(yuán)，是一(yī)種關鍵的重編程因子，在保持胚胎幹細胞（ESCs）的多能性和自我(wǒ)更新狀态方面具有顯著作用。最近的研究表明，OCT4參與維持OSCC癌症幹細胞（CSC）的存活，對口腔癌的發生(shēng)、複發、轉移和預後具有深遠的影響。因此，我(wǒ)們總結了OCT4的結構、亞型、功能及其在OSCC的發生(shēng)、發展和預後中(zhōng)的作用。

關鍵詞組：癌症幹細胞（CSC）；八聚體(tǐ)結合轉錄因子4（OCT4）；口腔鱗狀細胞癌（OSCC）；預後；信号通路

Research Articles

Genetic and histological relationship between pheromone-secreting tissues of the musk gland and skin of juvenile Chinese forest musk deer (Moschus berezovskii Flerov, 1929)

Long LI, Heran CAO, Jinmeng YANG, Tianqi JIN, Yuxuan MA, Yang WANG, Zhenpeng LI, Yining CHEN, Huihui GAO, Chao ZHU, Tianhao YANG, Yalong DENG, Fangxia YANG, Wuzi DONG

DOI: 10.1631/jzus.B2200692 Downloaded: 534 Clicked: 651 Cited: 0 Commented: 0(p.807-822) <Full Text> <PPT> 112

Chinese summary <7> 中(zhōng)國幼年林麝（Moschus berezovskii Flerov, 1929）香腺和皮膚分(fēn)泌信息素的遺傳和組織學關系

李龍¹，曹賀然^1,3，楊瑾萌¹，靳添淇¹，馬宇軒¹，汪洋¹，李振鵬¹，陳怡甯¹，高慧慧¹，朱超¹，揚天豪¹，鄧亞龍¹，楊芳霞^2,3，董武子^1,3
¹西北(běi)農林科技大(dà)學動物(wù)科技學院，中(zhōng)國陝西省楊淩區，712100
²西北(běi)農林科技大(dà)學林學院，中(zhōng)國陝西省楊淩區，712100
³西北(běi)農林科技大(dà)學秦嶺野生(shēng)動物(wù)生(shēng)物(wù)學研究中(zhōng)心，中(zhōng)國陝西省楊淩區，712100
摘要：中(zhōng)國林麝成年雄性的香腺，被認爲是一(yī)種特殊的皮膚腺體(tǐ)，能夠分(fēn)泌皮脂、脂質和蛋白(bái)質等物(wù)質進入林麝的香囊。香囊中(zhōng)的物(wù)質成熟後稱之爲麝香，雄性林麝分(fēn)泌的麝香用來在繁殖季節吸引雌性林麝，且在藥用價值和領域标記方面起着重要作用。由于林麝作爲國家一(yī)級保護動物(wù)，組織樣品非常珍貴且難以獲得，因此中(zhōng)國林麝的麝香腺與皮膚之間的關系仍未被發現。本研究利用組織形态學、RNA測序（RNA-seq）和免疫組化等方法對中(zhōng)國林麝的麝香腺和皮膚進行了檢測，并評估了關鍵調控基因的表達，同時分(fēn)析皮膚（背部皮膚和腹部皮膚）和香腺的組織結構以确定麝香腺是否來源于皮膚。本研究主要得到如下(xià)結果：（1）林麝皮膚和香腺組織共同表達的基因高達88.24%，且Metascap預測分(fēn)析工(gōng)具證明麝香腺體(tǐ)中(zhōng)表達的基因具有皮膚組織特異性；（2）免疫化學和分(fēn)子生(shēng)物(wù)實驗證實關鍵調控基因在皮膚和香腺中(zhōng)均有表達；（3）組織形态學分(fēn)析結果證實在組織空間結構上香腺和皮膚組織中(zhōng)均含有皮脂腺，推測其原因是麝香中(zhōng)主要成分(fēn)是脂肪酸（71.55%），且皮脂腺和毛囊作爲一(yī)個結構單元參與林麝信息素的分(fēn)泌。

關鍵詞組：林麝；信息素；麝香腺；皮膚組織；轉錄組；皮脂腺

Exploring the links between gut microbiome changes and irritable bowel syndrome in Han populations in the Tibetan Plateau

Xingguang ZHANG, Wei XU, Weilong ZHONG, Wencheng ZHANG, Cheng YANG, Lisa DUAN, Haiyan NIU, Yanmei DONG, Taotao LIU, Shihai XIA, Bangmao WANG

DOI: 10.1631/jzus.B2200509 Downloaded: 577 Clicked: 1060 Cited: 0 Commented: 0(p.823-838) <Full Text> <PPT> 135

Chinese summary <7> 西藏高原漢族人群的腸道微生(shēng)物(wù)變化與腸易激綜合征之間的關系研究

張興光^1,2，許威²，仲威龍¹，張文成²，楊程²，段力薩²，牛海豔²，董豔美²，劉濤濤²，夏時海²，王邦茂¹
¹天津醫科大(dà)學總醫院消化内科，天津市消化疾病研究所，天津市消化疾病重點實驗室，中(zhōng)國天津市，300052
²武警特色醫學中(zhōng)心消化内科，天津市肝髒胰腺纖維化與分(fēn)子診療重點實驗室，中(zhōng)國天津市，300162
摘要：腸道微生(shēng)态受高原環境的影響，微生(shēng)态失調在腸易激綜合征（IBS）的發病機制中(zhōng)起着重要作用，但高原環境對漢族人群腸道微生(shēng)物(wù)的變化的影響及高原環境對IBS發生(shēng)的相關性有待進一(yī)步地研究。在本項研究中(zhōng)，我(wǒ)們前瞻性地對從平原進入高原環境工(gōng)作生(shēng)活的一(yī)組健康隊列進行了一(yī)年的随訪，并對其中(zhōng)一(yī)些人的糞便樣本進行了16S核糖體(tǐ)RNA（16S rRNA）測序分(fēn)析。根據參與者的臨床症狀，與IBS問卷相結合，篩選出隊列中(zhōng)的IBS患者。結果表明：高原環境可導緻腸道微生(shēng)物(wù)多樣性和組成的變化，并随着在高原停留時間的延長，腸道微生(shēng)物(wù)表現出适應性的動态變化，恢複到接近進入高原前的水平，IBS的症狀也明顯緩解。因此，我(wǒ)們推測高原環境可能是誘發IBS的特殊環境。已被證實在IBS的發病機制中(zhōng)發揮重要作用的分(fēn)類物(wù)種g_Alistipes、g_Oscillospira和s_Ruminococcus_torques在高海拔地區IBS隊列中(zhōng)也被發現。總之，高原環境導緻的腸道微生(shēng)物(wù)失調可能導緻了IBS在高原環境中(zhōng)的高發生(shēng)率，同時心理因素可能也參與了高原環境下(xià)IBS的發生(shēng)，具體(tǐ)的相關機制需要進一(yī)步的研究。

關鍵詞組：腸道微生(shēng)物(wù)；高原環境；腸易激綜合征

Construction and evaluation of in-house methylation-sensitive SNaPshot system and three classification prediction models for identifying the tissue origin of body fluid

Yating FANG, Man CHEN, Bofeng ZHU

DOI: 10.1631/jzus.B2200555 Downloaded: 500 Clicked: 689 Cited: 0 Commented: 0(p.839-852) <Full Text> <PPT> 125

Chinese summary <7> 鑒定體(tǐ)液來源的甲基化敏感性SNaPshot體(tǐ)系及三種預測模型的構建與評估

方雅婷^1,2，陳曼¹，朱波峰^1,3
¹南(nán)方醫科大(dà)學法醫學學院，廣州市法醫多組學精準鑒定重點實驗室，中(zhōng)國廣州市，510515
²安徽醫科大(dà)學基礎醫學院，中(zhōng)國合肥市，230031
³南(nán)方醫科大(dà)學珠江醫院檢驗醫學科微生(shēng)物(wù)組醫學中(zhōng)心，中(zhōng)國廣州市，510515
摘要：體(tǐ)液組織來源的鑒定可爲刑事案件的偵查提供線索和證據。爲了建立一(yī)種高效的法醫學體(tǐ)液鑒定方法，本研究選取了8個新的體(tǐ)液特異性DNA甲基化标志(zhì)物(wù)，并基于這些标志(zhì)物(wù)構建了可用于5種常見體(tǐ)液（靜脈血、唾液、經血、陰道液和精液）鑒定的多重單堿基延伸反應（SNaPshot）體(tǐ)系。結果表明，該系統具有良好的物(wù)種特異性和靈敏度，可用于混合生(shēng)物(wù)樣本的鑒定。同時，本研究利用前期研究數據構建了一(yī)個人工(gōng)體(tǐ)液預測模型和兩個分(fēn)别基于支持向量機和随機森(sēn)林算法的機器學習預測模型，并利用本研究獲得的檢測數據（n=95）對這些預測模型進行了測試。基于研究者經驗建立的人工(gōng)預測模型的準确率爲95.79%，支持向量機預測模型對除唾液（96.84%）外(wài)的所有體(tǐ)液的預測準确率均爲100.00%，随機森(sēn)林預測模型對5種體(tǐ)液的預測準确率均爲100.00%。綜上所述，我(wǒ)們所構建的SNaPshot系統和随機森(sēn)林預測模型能夠實現體(tǐ)液組織來源的準确鑒定。

關鍵詞組：DNA甲基化；體(tǐ)液；法醫鑒定；單堿基延伸反應（SNaPshot）；機器學習