Journal of Zhejiang University

Current Issue: <JZUS-B>

Journal of Zhejiang University-SCIENCE B (Biomedicine & Biotechnology)

ISSNs 1673-1581 (Print); 1862-1783 (Online); CN 33-1356/Q; started in 2005,Monthly.

JZUS-B is an international "Biomedicine & Biotechnology" reviewed-Journal indexed by SCI-E, MEDLINE, PMC, BA, BIOSIS Previews, JST, ZR, CA, SA, AJ, ZM, CABI, CSA, etc., and supported by the National Natural Science Foundation of China. It mainly covers research in Biomedicine, Biochemistry and Biotechnology, etc.

Impact factor: 1.099 (2011), 1.108 (2012), 1.293 (2013), 1.278 (2014), 1.303 (2015), 1.676 (2016), 1.815 (2017), 1.879 (2018).

Journal of Zhejiang University SCIENCE B

ISSN 1673-1581(Print), 1862-1783(Online), Monthly

2016 Vol.17 No.8 P.569-648

<<< CONTENTS >>>

Articles

Comparative genomic analysis of Lactobacillus plantarum ZJ316 reveals its genetic adaptation and potential probiotic profiles

Ping Li, Xuan Li, Qing Gu, Xiu-yu Lou, Xiao-mei Zhang, Da-feng Song, Chen Zhang

DOI: 10.1631/jzus.B1600176 Downloaded: 2984 Clicked: 4606 Cited: 0 Commented: 0(p.569-579) <Full Text> <PPT> 1827

Chinese summary <33> 比較基因組學揭示植物(wù)乳杆菌ZJ316的生(shēng)境适應性及潛在益生(shēng)特性

目的：前期研究發現植物(wù)乳杆菌ZJ316能顯著抑制病原菌，促進仔豬生(shēng)長，提高豬肉質量等，本研究拟在ZJ316全基因組測序的基礎上，運用比較基因組學手段揭示與其生(shēng)境适應性及益生(shēng)特性相關基因。
創新點：首次從基因水平上分(fēn)析與植物(wù)乳杆菌ZJ316的生(shēng)境适應性、抑菌活性及益生(shēng)特性等相關的基因，爲進一(yī)步揭示其生(shēng)理功能打下(xià)基礎。
方法：運用BLASTN、Mauve和MUMmer等将植物(wù)乳杆菌ZJ316全基因組序列與已測序的8個植物(wù)乳杆菌全基因組序列進行比對及分(fēn)析；用CRISPRFinder尋找CRISPR重複序列。
結論：植物(wù)乳杆菌ZJ316包含碳水化合物(wù)的運輸和代謝、蛋白(bái)水解酶系統和氨基酸的生(shēng)物(wù)合成等相關基因，具有CRISPR、應激反應、耐膽鹽、粘附宿主腸壁、胞外(wài)多糖、生(shēng)物(wù)合成和細菌素生(shēng)物(wù)合成等相關基因。這些基因的功能是其作爲益生(shēng)菌的重要特征和基礎。

關鍵詞組：植物(wù)乳杆菌ZJ316；比較基因組學；益生(shēng)菌；适應性

Effects of temperature and diet on length-weight relationship and condition factor of the juvenile Malabar blood snapper (Lutjanus malabaricus Bloch & Schneider, 1801)

Sabuj Kanti Mazumder, Simon Kumar Das, Yosni Bakar, Mazlan Abd. Ghaffar

DOI: 10.1631/jzus.B1500251 Downloaded: 2481 Clicked: 3951 Cited: 2 Commented: 0(p.580-590) <Full Text> <PPT> 1548

Chinese summary <29> 溫度和喂食影響摩拉吧笛鲷體(tǐ)長體(tǐ)重關系和肥滿度的研究

目的：分(fēn)析水溫度和喂食對摩拉吧笛鲷體(tǐ)長體(tǐ)重關系和肥滿度的影響。
創新點：本研究采用條件可控的流通式海水系統，對摩拉吧笛鲷的體(tǐ)長體(tǐ)重關系和肥滿度進行研究。
方法：本研究使用流通式海水系統在實驗室中(zhōng)實施，選取4種不同溫度（22、26、30和34 °C）和2種飲食條件（商(shāng)業顆粒和自然蝦米），每天喂食2次，比較鲷魚體(tǐ)長體(tǐ)重關系和肥滿度差異。
結論：結果表明，摩拉吧笛鲷的最好飼養條件是30 °C，而喂食種類對摩拉吧笛鲷的生(shēng)長和肥滿度的影響沒有顯著差異。本研究提供了溫度和飲食對摩拉吧笛鲷體(tǐ)長體(tǐ)重關系和肥滿度影響的基本信息，可用于該物(wù)種的生(shēng)理狀态評估。

關鍵詞組：體(tǐ)長體(tǐ)重關系；肥滿度；溫度；生(shēng)長；水産養殖；鲷魚

Association of VIPR-1 gene polymorphisms and haplotypes with egg production in laying quails

Yue-jin Pu, Yan Wu, Xiao-juan Xu, Jin-ping Du, Yan-zhang Gong

DOI: 10.1631/jzus.B1500199 Downloaded: 2391 Clicked: 4213 Cited: 0 Commented: 0(p.591-596) <Full Text> <PPT> 1835

Chinese summary <32> VIPR-1基因多态性及其單倍型與蛋用鹌鹑産蛋性能的相關性研究

目的：蛋用鹌鹑VIPR-1基因單核苷酸多态性（SNP）研究。
創新點：首次開(kāi)展蛋用鹌鹑VIPR-1基因多态性研究，發現了兩個與蛋重相關的多态性位點。
方法：以VIPR-1基因設計引物(wù)，進行聚合酶鏈式反應-限制片段長度多态性分(fēn)析，獲得基因突變位點。并通過關聯性分(fēn)析，研究基因多态性與繁殖性狀之間的相關性。
結論：在個體(tǐ)數爲443個（202隻L個體(tǐ)、196隻H個體(tǐ)和45隻野生(shēng)鹌鹑個體(tǐ)）的群體(tǐ)中(zhōng)發現兩個突變位點（G373T和A313G），且兩位點間存在微弱的連鎖不平衡。相關性分(fēn)析表明，SNP多态性與鹌鹑蛋重之間存在明顯的相關性。組成的7個主要二倍型中(zhōng)，含有h1h2（GGGT）的個體(tǐ)總是表現爲較小(xiǎo)的蛋重及較大(dà)的産蛋數。

關鍵詞組：血管活性腸肽；多态性；單倍型；VIPR-1基因；産蛋性能相關性

Probiotic properties of lactic acid bacteria isolated from traditionally fermented Xinjiang cheese

Ramila Azat, Yan Liu, Wei Li, Abdurihim Kayir, Ding-bo Lin, Wen-wen Zhou, Xiao-dong Zheng

DOI: 10.1631/jzus.B1500250 Downloaded: 2804 Clicked: 4737 Cited: 2 Commented: 0(p.597-609) <Full Text> <PPT> 1648

Chinese summary <27> 新疆傳統發酵奶酪中(zhōng)乳酸菌的益生(shēng)特性研究

目的：分(fēn)離(lí)鑒定新疆牧民家庭自制的4份奶酪樣品中(zhōng)的6株乳酸菌，研究其益生(shēng)特性。
創新點：通過對新疆傳統發酵乳制品中(zhōng)乳酸菌的分(fēn)離(lí)及其抗氧化和降脂特性的測定，篩選到益生(shēng)特性良好同時也能延長模式生(shēng)物(wù)秀麗線蟲壽命的菌株。
方法：對分(fēn)離(lí)自傳統發酵乳制品中(zhōng)的乳酸菌進行生(shēng)理生(shēng)化分(fēn)析和16S rDNA分(fēn)子生(shēng)物(wù)學鑒定，篩選出6株乳酸菌，并測定其耐酸、耐膽鹽、抑菌、親水性和共聚集能力；測定其抗氧化、降解膽固醇和甘油三酯的能力；測定乳酸菌對秀麗線蟲壽命的影響。
結論：實驗表明，該6株菌具有較好的耐酸性，在膽鹽環境中(zhōng)也有較好的存活率。同時，這6株菌均有清除自由基和降解脂肪的能力。此外(wài)，其中(zhōng)3株具有延長秀麗線蟲壽命的能力。綜上所述，這6株菌具有較好的益生(shēng)特性，可作爲優良的潛在益生(shēng)菌株。

關鍵詞組：新疆奶酪；乳酸菌；益生(shēng)特性；秀麗線蟲；壽命

Chryseobacterium chengduensis sp. nov. isolated from the air of captive giant panda enclosures in Chengdu, China

Cai-fang Wen, Li-xin Xi, Shan Zhao, Zhong-xiang Hao, Lu Luo, Hong Liao, Zhen-rong Chen, Rong She, Guo-quan Han, San-jie Cao, Rui Wu, Qi-gui Yan, Rong Hou

DOI: 10.1631/jzus.B1500214 Downloaded: 2418 Clicked: 3816 Cited: 1 Commented: 0(p.610-618) <Full Text> <PPT> 1591

Chinese summary <26> 分(fēn)離(lí)自成都大(dà)熊貓獸舍空氣中(zhōng)的一(yī)株金黃杆菌屬新種的鑒定

目的：鑒定菌株25-1^T是否是金黃杆菌屬的一(yī)個新種。
創新點：首次從空氣中(zhōng)分(fēn)離(lí)到金黃杆菌屬的新種。
方法：革蘭氏染色鏡檢；磷鎢酸染色然後透射電鏡觀察菌株25-1^T形态結構；全自動生(shēng)理生(shēng)化鑒定系統（Phoenix™-100）與傳統生(shēng)理生(shēng)化反應管相結合；H890氣象色譜儀進行脂肪酸組分(fēn)分(fēn)析；薄闆雙相層析進行極性脂組分(fēn)分(fēn)析；反相高壓液相色譜分(fēn)析法進行呼吸琨組分(fēn)分(fēn)析；熔解溫度法檢測G+C摩爾含量；16S rRNA序列測定及系統發生(shēng)分(fēn)析。
結論：根據傳統特征分(fēn)類研究結果（形态特征、培養特性和生(shēng)理生(shēng)化特征）、化學分(fēn)類研究結果（脂肪酸組分(fēn)、極性脂組分(fēn)和呼吸琨組分(fēn)）和遺傳特征分(fēn)類研究結果（G+C摩爾含量、DNA同源性測定和16S rRNA序列測定及系統發生(shēng)分(fēn)析）得出菌株25-1^T爲金黃杆菌屬的一(yī)個新種。

關鍵詞組：成都源金黃杆菌；大(dà)熊貓；16S rRNA測序；系統發育樹(shù)分(fēn)析；菌株25-1^T

Statistical culture-based strategies to enhance chlamydospore production by Trichoderma harzianum SH2303 in liquid fermentation

Ya-qian Li, Kai Song, Ya-chai Li, Jie Chen

DOI: 10.1631/jzus.B1500226 Downloaded: 2598 Clicked: 4230 Cited: 0 Commented: 0(p.619-627) <Full Text> <PPT> 1900

Chinese summary <26> 哈茨木黴菌SH2303高産厚垣孢子液體(tǐ)發酵優化

目的：鑒于厚垣孢子爲主要活性成分(fēn)的木黴菌劑具有抗逆性強、存活期長、易貯藏等特點，更容易滿足實際生(shēng)産需求，本文利用系統的液體(tǐ)發酵策略，優化木黴菌高産厚垣孢子液體(tǐ)發酵條件，同時降低發酵成本，指導未來木黴菌厚垣孢子生(shēng)防菌劑研發。
創新點：采用從開(kāi)放(fàng)到閉合的遞進式液體(tǐ)發酵篩選優化模式，通過Plackett-Burman設計和Box-Behnken優化設計确定影響木黴菌産厚垣孢子的關鍵因子及最佳發酵條件，确定玉米粉作爲基礎培養基，添加甘油和調節pH相結合的液體(tǐ)發酵策略，在降低發酵成本的同時提高厚垣孢子産量。
方法：以玉米粉爲基礎培養基，通過Plackett-Burman篩選實驗，從8個候選的發酵因子中(zhōng)初步确定玉米粉、甘油和發酵液起始pH值三個顯著因子。進而利用響應面中(zhōng)的Box-Behnken設計（表5）三個因素爲自變量，厚垣孢子産量爲響應值，通過Design Expert 7.0軟件對實驗數據進行多項式回歸分(fēn)析，建立多元二次回歸方程。通過方差分(fēn)析，最終确定木黴菌SH2303高産厚垣孢子液體(tǐ)發酵工(gōng)藝的最佳參數。
結論：确定了影響厚垣孢子形成的三個關鍵的發酵因子：玉米粉、甘油和起始pH值。獲得厚垣孢子形成最佳的液體(tǐ)發酵條件：玉米粉62.86 g/L，甘油 7.54 ml/L，起始pH 4.17，發酵6天。實際最大(dà)厚垣孢子産量4.5×10⁸ 孢子/ml，與模型預測值3.6×10⁸ 孢子/ml相當。厚垣孢子産量與優化前相比提高8倍，可用于指導低成本的木黴菌厚垣孢子新型生(shēng)防菌劑開(kāi)發。

關鍵詞組：哈茨木黴菌SH2303厚垣孢子；Plackett-Burman篩選；Box-Behnken設計；液體(tǐ)發酵優化

Emergy assessment of three home courtyard agriculture production systems in Tibet Autonomous Region, China

Fa-chun Guan, Zhi-peng Sha, Yu-yang Zhang, Jun-feng Wang, Chao Wang

DOI: 10.1631/jzus.B1500154 Downloaded: 2355 Clicked: 4105 Cited: 0 Commented: 0(p.628-639) <Full Text> <PPT> 1595

Chinese summary <24> 西藏三種庭院生(shēng)産體(tǐ)系的能值評價

目的：利用能值方法評價西藏三種庭院生(shēng)産體(tǐ)系的生(shēng)産效率、環境效益、可持續性以及經濟效益。
創新點：利用能值方法，首次對近年流行的新型農牧一(yī)體(tǐ)化生(shēng)産模式（"玉米田養鵝"），以及西藏常規庭院生(shēng)産體(tǐ)系"豌豆–小(xiǎo)麥輪作"和"常規玉米連作"進行生(shēng)态與生(shēng)産效益的全面評價，明确适宜西藏可持續發展的庭院生(shēng)産技術體(tǐ)系。
方法：以兩年（2012和2013）作爲時間單元，記錄期間各庭院生(shēng)産體(tǐ)系物(wù)質的投入和産出。各生(shēng)産體(tǐ)系中(zhōng)所有投入和産出的物(wù)質與各物(wù)質相對的轉化系數即單位能值價值（UEV）相乘轉換爲太陽能值（sej），各物(wù)質的UEV統一(yī)全球驅動能值在15.20×10²⁴ sej/year的基準上。利用"可新比例"劃分(fēn)各投入物(wù)質的可更新和不可更新的部分(fēn)，并計算相應的能值指标（能值産出率、能值自給率、環境負載率、可持續性指标以及農産品安全指标等），從而通過能值指标和經濟效益的分(fēn)析來評價各庭院生(shēng)産體(tǐ)系的生(shēng)态與經濟效益。
結論：本研究中(zhōng)"玉米田養鵝"具有卓越的生(shēng)态–經濟效益，"豌豆–小(xiǎo)麥輪作"次之，而"常規玉米連作"可持續性低且環境負載較大(dà)。

關鍵詞組：庭院農業；玉米田養鵝；傳統玉米種植；豌豆–小(xiǎo)麥輪作；能值；可持續性

Effect of Tai Chi exercise on blood lipid profiles: a meta-analysis of randomized controlled trials

Xiao-hong Pan, Amina Mahemuti, Xue-hua Zhang, Ya-ping Wang, Po Hu, Ju-bo Jiang, Mei-xiang Xiang, Gang Liu, Jian-an Wang

DOI: 10.1631/jzus.B1600052 Downloaded: 2145 Clicked: 4064 Cited: 3 Commented: 0(p.640-648) <Full Text> <PPT> 1722

Chinese summary <26> 太極鍛煉對血脂的臨床療效：随機對照試驗的meta分(fēn)析

目的：探讨太極鍛煉是否能改善血脂水平。
創新點：明确太極鍛煉對血脂的影響，爲非藥物(wù)調脂治療提供新手段。
方法：通過篩選太極鍛煉持續4周以上，PEDro評分(fēn)3分(fēn)以上，且觀察太極鍛煉對血脂影響的成人随機對照試驗，meta分(fēn)析太極鍛煉對總膽固醇、低密度脂蛋白(bái)膽固醇、高密度脂蛋白(bái)膽固醇和甘油三酯的影響。
結論：通過meta分(fēn)析最終入選的6項研究（共445例患者）的結果顯示，太極鍛煉能顯著降低血甘油三酯水平，且有降低總膽固醇的趨勢，但是對于低密度脂蛋白(bái)膽固醇和高密度脂蛋白(bái)膽固醇未發現有明顯影響。

關鍵詞組：太極；血脂；甘油三酯；Meta分(fēn)析

Chinese summary <33> 比較基因組學揭示植物(wù)乳杆菌ZJ316的生(shēng)境适 應性及潛在益生(shēng)特性