Journal of Zhejiang University

Current Issue: <JZUS-B>

Journal of Zhejiang University-SCIENCE B (Biomedicine & Biotechnology)

ISSNs 1673-1581 (Print); 1862-1783 (Online); CN 33-1356/Q; started in 2005,Monthly.

JZUS-B is an international "Biomedicine & Biotechnology" reviewed-Journal indexed by SCI-E, MEDLINE, PMC, BA, BIOSIS Previews, JST, ZR, CA, SA, AJ, ZM, CABI, CSA, etc., and supported by the National Natural Science Foundation of China. It mainly covers research in Biomedicine, Biochemistry and Biotechnology, etc.

Impact factor: 1.099 (2011), 1.108 (2012), 1.293 (2013), 1.278 (2014), 1.303 (2015), 1.676 (2016), 1.815 (2017), 1.879 (2018).

Journal of Zhejiang University SCIENCE B

ISSN 1673-1581(Print), 1862-1783(Online), Monthly

2022 Vol.23 No.5 P.353-436

Cover:

<221>

Contents:

<188>

<<< CONTENTS >>>

Review

Review: Therapeutic potential of traditional Chinese medicine for vascular endothelial growth factor

Yijia MAO, Lingkai MENG, Huayi LIU, Yuting LU, Kuo YANG, Guangze OUYANG, Yanran BAN, Shuang CHEN

DOI: 10.1631/jzus.B2101055 Downloaded: 1015 Clicked: 1328 Cited: 0 Commented: 0(p.353-364) <Full Text> <PPT> 271

Chinese summary <22> 中(zhōng)藥對血管内皮生(shēng)長因子的治療潛力

概要：血管内皮生(shēng)長因子是胚胎發育、骨骼生(shēng)長、生(shēng)殖功能等過程中(zhōng)生(shēng)理性血管生(shēng)成的共同調節因子，同時也參與一(yī)系列的病理變化。中(zhōng)醫有2000多年的曆史，在臨床上得到了廣泛的應用，但對中(zhōng)醫機制的探索才剛剛開(kāi)始。本文總結了近年來中(zhōng)醫藥幹預血管内皮生(shēng)長因子的相關研究，發現許多中(zhōng)藥和方劑對血管内皮生(shēng)長因子具有調節作用，說明中(zhōng)醫藥作爲補充和替代療法具有廣闊的前景，爲臨床提供新的治療思路，并爲中(zhōng)醫藥的機制研究提供理論依據。

關鍵詞組：血管内皮生(shēng)長因子；血管内皮生(shēng)長因子受體(tǐ)；中(zhōng)醫藥

Research Articles

Physicochemical properties, molecular structure, antioxidant activity, and biological function of extracellular melanin from Ascosphaera apis

Zhi LI, Hui HENG, Qiqian QIN, Lanchun CHEN, Yuedi WANG, Zeyang ZHOU

DOI: 10.1631/jzus.B2100718 Downloaded: 1073 Clicked: 1376 Cited: 0 Commented: 0(p.365-381) <Full Text> <PPT> 280

Chinese summary <21> 病原真菌球囊菌産細胞外(wài)黑色素的理化性質、分(fēn)子結構、抗氧化活性和生(shēng)物(wù)學功能研究

目的：提取和純化球囊菌黑色素，并系統研究其理化性質、分(fēn)子結構、抗氧化活性和生(shēng)物(wù)學功能，爲病原真菌黑色素的鑒定提供完整的流程标準，同時爲後續研究該黑色素在球囊菌感染蜜蜂中(zhōng)的作用提供參考。
創新點：首次提取和鑒定球囊菌黑色素，并建立了一(yī)套系統的鑒定真菌黑色素的流程。
方法：通過酸水解結合堿熔解法提取和純化黑色素，并綜合采用紫外(wài)-可見光譜、紅外(wài)光譜、拉曼光譜、氣相色譜、核磁共振技術、掃描電子和透射電鏡、自由基清除等分(fēn)析法，系統、全面地研究黑色素的溶解度、顔色值、元素組成、化學結構、生(shēng)物(wù)活性、亞細胞定位和抗氧化活性。同時，采用三環唑抑制黑色素的合成研究黑色素與孢子感染能力之間的關系。
結論：球囊菌黑色素屬于真黑色素，定位于孢子壁，具有抗氧化活性，且能螯合金屬離(lí)子，但是它不能增強孢子毒力。

關鍵詞組：黑色素；分(fēn)子結構；抗氧化活性；亞細胞定位；球囊菌

Can SpRY recognize any PAM in human cells?

Jinbin YE, Haitao XI, Yilu CHEN, Qishu CHEN, Xiaosheng LU, Jineng LV, Yamin CHEN, Feng GU, Junzhao ZHAO

DOI: 10.1631/jzus.B2100710 Downloaded: 923 Clicked: 1100 Cited: 0 Commented: 0(p.382-391) <Full Text> <PPT> 257

Chinese summary <20> SpRY能識别人類細胞中(zhōng)前間區序列鄰近基序嗎(ma)？

目的：确定SpCas9突變體(tǐ)（SpRY）可以識别人類細胞中(zhōng)的前間區序列鄰近基序（PAM），爲SpRY在基因編輯中(zhōng)的應用提供參考。
創新點：利用可視序列切除定義PAM（PAM Definition by Observable Sequence Excision，PAM-DOSE）和綠色熒光報告系統這兩種不同方法，确定了SpRY在人類細胞中(zhōng)介導有效切割時對PAM的要求。
方法：通過在PAM-DOSE法确定SpRY的PAM偏好性，并通過綠色熒光報告系統測試SpRY識别的PAM，同時總結SpRY在人類細胞中(zhōng)可被識别的PAM序列。
結論：5’-NRN-3’、5’-NTA-3’和5’-NCK-3’作爲SpRY主要識别的PAMs，同時5’-NCA-3’和5’-NTK-3’可作爲SpRY的次選PAM，且不推薦使用5’-NYC-3’。

關鍵詞組：CRISPR/Cas；SpRY；前間區序列鄰近基序（PAM）；識别

Romidepsin (FK228) improves the survival of allogeneic skin grafts through downregulating the production of donor-specific antibody via suppressing the IRE1α-XBP1 pathway

Yuliang GUO, Siyu SONG, Xiaoxiao DU, Li TIAN, Man ZHANG, Hongmin ZHOU, Zhonghua Klaus CHEN, Sheng CHANG

DOI: 10.1631/jzus.B2100780 Downloaded: 1044 Clicked: 1403 Cited: 0 Commented: 0(p.392-406) <Full Text> <PPT> 302

Chinese summary <19> FK228通過抑制IRE1α-XBP1通路減少供者特異性抗體(tǐ)的産生(shēng)改善同種異體(tǐ)皮膚移植物(wù)的存活

目的：探究組蛋白(bái)去(qù)乙酰化酶（HDAC）抑制劑FK228在體(tǐ)内和體(tǐ)外(wài)B細胞抗體(tǐ)産生(shēng)過程中(zhōng)的生(shēng)物(wù)學作用及其機制。
創新點：首次對FK228在二次同種異體(tǐ)皮膚移植模型中(zhōng)免疫調節作用進行研究，并初步解析了相關作用機制。
方法：通過建立同種異體(tǐ)小(xiǎo)鼠二次皮膚移植模型，以研究FK228對供者特異性抗體(tǐ)（DSA）的影響。每天監測移植皮膚的存活。通過流式細胞術評估受體(tǐ)血清中(zhōng)DSA水平和脾髒中(zhōng)免疫細胞的數量。然後，我(wǒ)們通過磁珠分(fēn)選在體(tǐ)外(wài)從B6小(xiǎo)鼠脾髒中(zhōng)分(fēn)離(lí)純化B細胞，在白(bái)細胞介素4（IL-4）和抗CD40共同刺激下(xià)培養B細胞，觀察FK228的作用。通過酶聯免疫吸附測定（ELISA）評估上清液中(zhōng)的IgG1和IgM水平。進行定量逆轉錄-聚合酶鏈反應（RT-qPCR）和蛋白(bái)質印迹以确定培養細胞和受體(tǐ)脾髒中(zhōng)漿細胞關鍵mRNA表達和IRE1α-XBP1通路蛋白(bái)質的相應水平。
結論：FK228處理後可減少二次皮膚移植模型和B細胞體(tǐ)外(wài)培養過程中(zhōng)抗體(tǐ)的産生(shēng)，并可改善同種異體(tǐ)皮膚移植物(wù)的存活。具體(tǐ)作用機制爲FK228通過作用于HDAC1和HDAC2，上調組蛋白(bái)H2A和H3的乙酰化水平，進而抑制抗體(tǐ)合成過程中(zhōng)的IRE1α-XBP1通路。研究結果爲臨床上治療AMR和延長移植器官的長期存活提供了新的思路。

關鍵詞組：皮膚移植；FK228；供者特異性抗體(tǐ)；未折疊蛋白(bái)反應

Proteomic characterization of four subtypes of M2 macrophages derived from human THP-1 cells

Pengfei LI, Chen MA, Jing LI, Shanshan YOU, Liuyi DANG, Jingyu WU, Zhifang HAO, Jun LI, Yuan ZHI, Lin CHEN, Shisheng SUN

DOI: 10.1631/jzus.B2100930 Downloaded: 1174 Clicked: 1181 Cited: 0 Commented: 0(p.407-422) <Full Text> <PPT> 265

Chinese summary <20> 人THP-1來源的四種M2巨噬細胞亞型的蛋白(bái)質組學特征

目的：探究THP-1來源的四種M2巨噬細胞亞型的蛋白(bái)質組學特征，爲進一(yī)步區分(fēn)M2亞型以及使用THP-1來源的巨噬細胞作爲臨床前研究的細胞模型提供數據基礎。
創新點：首次系統性地對四種M2巨噬細胞亞型的蛋白(bái)質組進行了分(fēn)析，并提供潛在的候選标志(zhì)物(wù)用于不同M2亞型的鑒定，爲巨噬細胞的可塑性、相關疾病以及免疫機制等方面的研究提供參考。
方法：在體(tǐ)外(wài)誘導THP-1單核細胞分(fēn)化爲M0、M1、M2a、M2b、M2c和M2d巨噬細胞，并利用基于質譜的無标記定量技術揭示了其蛋白(bái)質組學特征。結合數據庫與生(shēng)物(wù)信息學分(fēn)析四種M2亞型共同或特異的生(shēng)物(wù)學功能及疾病關聯。此外(wài)，通過靶向蛋白(bái)質組學技術分(fēn)析了四種M2巨噬細胞亞型中(zhōng)共同或特異上調的蛋白(bái)。
結論：本研究首次揭示了THP-1衍生(shēng)的四種M2巨噬細胞亞型的蛋白(bái)質組學特征。不僅驗證了幾個已知(zhī)的巨噬細胞标記物(wù)，也提供了一(yī)份新的候選标記物(wù)列表，用于識别M2a、M2b、M2c和M2d巨噬細胞。一(yī)個主要發現是M2a和M2c以及M2b和M2d的蛋白(bái)表達譜非常相似。本研究的數據爲未來研究巨噬細胞相關疾病的免疫調節機制以及使用THP-1來源的巨噬細胞模型進行臨床前研究提供了寶貴的資(zī)源。

關鍵詞組：巨噬細胞；THP-1細胞；M2亞型；蛋白(bái)質組學；生(shēng)物(wù)學功能

Correspondence

Correspondence: HucMSC-Ex alleviates inflammatory bowel disease via the lnc78583-mediated miR3202/HOXB13 pathway

Yuting XU, Li ZHANG, Dickson Kofi Wiredu OCANSEY, Bo WANG, Yilin HOU, Rong MEI, Yongmin YAN, Xu ZHANG, Zhaoyang ZHANG, Fei MAO

DOI: 10.1631/jzus.B2100793 Downloaded: 1378 Clicked: 1282 Cited: 0 Commented: 0(p.423-431) <Full Text> <PPT> 320

Chinese summary <19> HucMSC-Ex通過調控lnc78583介導的miR3202/HOXB13通路緩解炎症性腸病

概要：炎症性腸病（IBD）是一(yī)組慢(màn)性、複發性腸道炎症，主要包括潰瘍性結腸炎（UC）和克羅恩病（CD）。IBD的發病機制很複雜(zá)，其潛在機制仍不清楚。近年來，人們對長鏈非編碼RNA（lncRNA）進行了研究，并将其确定爲IBD的潛在生(shēng)物(wù)标志(zhì)物(wù)。在本研究中(zhōng)，通過使用高通量RNA測序篩選出一(yī)種新的lncRNA-lnc78583。前期熒光定量聚合酶鏈式反應（qRT-PCR）分(fēn)析結果表明，lnc78583和同源框B13（HOXB13）的mRNA表達水平在IBD患者和炎症狀态下(xià)的人結直腸黏膜上皮細胞（FHC）中(zhōng)顯著降低。爲了探索lnc78583在腸道炎症環境中(zhōng)的作用機制，我(wǒ)們通過對FHC進行lnc78583過表達處理，發現不僅增加了HOXB13和IL-10的表達，而且增強了細胞活力，降低了LDH的釋放(fàng)和p-NF-κB的激活。随後，我(wǒ)們用人臍帶間充質幹細胞來源的外(wài)泌體(tǐ)（hucMSC-Ex）處理FHC，結果表明其上調了lnc78583和HOXB13的表達。此外(wài)，進一(yī)步預測到miR3202在FHC中(zhōng)和lnc78583以及HOXB13呈負相關作用。lnc78583的過表達下(xià)調miR3202，而miR3202模拟物(wù)顯着降低HOXB13的表達水平。綜上，我(wǒ)們的研究初步證明hucMSC-Ex通過lnc78583介導的miR3202/HOXB13通路調節IBD的炎症進程，從而爲IBD提供新的診斷方案和治療策略。

關鍵詞組：炎症性腸病；長鏈非編碼RNA（lncRNA）；HOXB13；miR3202；間充質幹細胞；外(wài)泌體(tǐ)

Correspondence: Prediction of birth weight in pregnancy with gestational diabetes mellitus using an artificial neural network

Menglin ZHOU, Jiansheng JI, Ni XIE, Danqing CHEN

DOI: 10.1631/jzus.B2100753 Downloaded: 912 Clicked: 1120 Cited: 0 Commented: 0(p.432-436) <Full Text> <PPT> 288

Chinese summary <22> 應用人工(gōng)神經網絡預測妊娠期糖尿病新生(shēng)兒出生(shēng)體(tǐ)重

目的：建立一(yī)個預測妊娠期糖尿病新生(shēng)兒出生(shēng)體(tǐ)重的人工(gōng)神經網絡模型，并評估其預測的準确性。
創新點：妊娠期糖尿病新生(shēng)兒出生(shēng)體(tǐ)重的預測十分(fēn)重要，但目前預測精度欠佳。本研究利用大(dà)樣本量的臨床數據，突破傳統統計學方法，應用機器學習建立了一(yī)個基于人工(gōng)神經網絡的預測模型，其預測精度較傳統方法有明顯提升。
方法：收集2462名妊娠期糖尿病孕婦的臨床數據，其中(zhōng)80%的數據用于構建一(yī)個前饋神經網絡模型，并用反向傳播算法和10折交叉驗證法訓練和優化；剩餘20%的數據用于驗證最終模型的性能，并将其與傳統方法進行比較。
結論：本研究構建的人工(gōng)神經網絡模型對妊娠期糖尿病新生(shēng)兒出生(shēng)體(tǐ)重具有較高的預測精度，其預測能力優于傳統方法，不足之處則在于其仍有可能會低估高出生(shēng)體(tǐ)重。

關鍵詞組：妊娠期糖尿病；出生(shēng)體(tǐ)重；預測；人工(gōng)神經網絡