Journal of Zhejiang University

Current Issue: <JZUS-B>

Journal of Zhejiang University-SCIENCE B (Biomedicine & Biotechnology)

ISSNs 1673-1581 (Print); 1862-1783 (Online); CN 33-1356/Q; started in 2005,Monthly.

JZUS-B is an international "Biomedicine & Biotechnology" reviewed-Journal indexed by SCI-E, MEDLINE, PMC, BA, BIOSIS Previews, JST, ZR, CA, SA, AJ, ZM, CABI, CSA, etc., and supported by the National Natural Science Foundation of China. It mainly covers research in Biomedicine, Biochemistry and Biotechnology, etc.

Impact factor: 1.099 (2011), 1.108 (2012), 1.293 (2013), 1.278 (2014), 1.303 (2015), 1.676 (2016), 1.815 (2017), 1.879 (2018).

Journal of Zhejiang University SCIENCE B

ISSN 1673-1581(Print), 1862-1783(Online), Monthly

2018 Vol.19 No.1 P.1-84

<<< CONTENTS >>>

Editorial

A warning for Chinese academic evaluation systems: short-term bibliometric measures misjudge the value of pioneering contributions

Xiao-jun Hu, Jian-hong Luo, Ronald Rousseau

DOI: 10.1631/jzus.B1700569 Downloaded: 1587 Clicked: 3119 Cited: 0 Commented: 0(p.1-5) <Full Text> <PPT> 1333

Chinese summary <19> 對中(zhōng)國學術評價體(tǐ)系的警示--短期文獻計量指标誤判科學先驅性工(gōng)作價值

概要:雖然用短期文獻計量指标評估科學家成就的現行做法在學術界受到許多争議和質疑,但是這一(yī)"根深蒂固"的觀念和評估方法在現實中(zhōng)一(yī)直難以改變,主要原因是長期以來在政策制定者、科學家和使用者之間存在着很大(dà)裂縫.爲糾正這種有明顯缺陷的"文獻計量"評估方法,我(wǒ)們對一(yī)些諾貝爾獎獲得者的主要論文,進行了基于大(dà)數據的引用特征系列研究.通過對觀察節點在科學引文索引數據庫(Web of Science)引用網絡中(zhōng)百萬篇論文節點間的深度關系分(fēn)析,我(wǒ)們發現:許多真正的奠基性工(gōng)作,并沒有像耀眼的火(huǒ)焰在科學星空中(zhōng)閃爍出燦爛光芒;相反,它們更像是導火(huǒ)索上的星星火(huǒ)花,點燃大(dà)量後續研究火(huǒ)焰繼而引發了科學界的轉型.結合資(zī)深專家訪談,我(wǒ)們呼籲科學同盟者們應該意識到,"誤用短期文獻計量指标"等同于"道義上犯罪",評價體(tǐ)系應該更強調"創新源頭",助推潛在的颠覆性與轉型性研究.

關鍵詞組：學術評價;科學先驅性工(gōng)作;諾貝爾獎;文獻計量指标;短期評估

Review

Review: Towards precision medicine: from quantitative imaging to radiomics

U. Rajendra Acharya, Yuki Hagiwara, Vidya K. Sudarshan, Wai Yee Chan, Kwan Hoong Ng

DOI: 10.1631/jzus.B1700260 Downloaded: 3185 Clicked: 4996 Cited: 0 Commented: 0(p.6-24) <Full Text> <PPT> 1580

Chinese summary <18> 精準醫學發展趨勢:從定量成像到放(fàng)射組學

概要:放(fàng)射學(影像學)及影像引導的介入手段能提供多參數的形态學及功能信息,在精準醫學中(zhōng)扮演着越來越重要的角色.因此,放(fàng)射科醫生(shēng)需要理解影像表型,并将這些表型與潛在的疾病相關聯,進而描述圖像特征.但是爲了能理解并描述異質性實體(tǐ)腫瘤的分(fēn)子表型(基因組學信息),就需要通過活檢取得這些組織更進一(yī)步的序列信息.因此,放(fàng)射科醫生(shēng)爲了能獲得詳盡的影像表型,需要從不同視圖和角度采集圖像,而這就産生(shēng)了大(dà)量的數據.從所有這些影像數據中(zhōng)提取有意義的細節非常具有挑戰性,并衍生(shēng)出了大(dà)數據這個命題.因爲影像組學有對診斷支持提供有意義的诠釋性和預測性信息的潛力,所以近年來對于影像組學的關注越來越多.影像組學是傳統的計算機輔助診斷、深度學習和人類技能的結合,因此它能被用來定量描述腫瘤表型.本文對影像組學流程的概覽、基于不同手段(如計算機斷層掃描(CT)、磁共振成像(MRI)和正電子發射計算機斷層掃描(PET))的影像組學研究結果、面臨的挑戰和影像組學對于精準醫學潛在的貢獻等方面進行了讨論.
(感謝浙江大(dà)學醫學院附屬第二醫院核醫學科陳琳提供中(zhōng)文概要)

關鍵詞組：放(fàng)射影像學;個體(tǐ)化醫學;精準醫學;定量成像;放(fàng)射基因組學;放(fàng)射組學

Articles

Gene locations may contribute to predicting gene regulatory relationships

Jun Meng, Wen-Yuan Xu, Xiao Chen, Tao Lin, Xiao-Yu Deng

DOI: 10.1631/jzus.B1700303 Downloaded: 1802 Clicked: 3346 Cited: 0 Commented: 0(p.25-37) <Full Text> <PPT> 1432

Chinese summary <19> 基因位置可以用于預測基因調控關系

目的:證明基因位置順序與基因調控順序的關系,說明利用基因位置順序信息可以作爲預測基因調控關系的先驗知(zhī)識.
創新點:通過研究與斑馬魚心髒發育階段有關的基因和miRNA,利用時空鄰域法,建立了一(yī)個基于時間的基因調控網絡.通過這個基因調控網絡,我(wǒ)們獲得了一(yī)些特殊的基因調控通路和基因之間調控的時間順序.通過研究斑馬魚心髒發育階段有關的基因在染色體(tǐ)上的位置,将基因位置順序與基因調控時間順序比較,我(wǒ)們發現了這兩個順序具有逆轉現象.這個逆轉現象的存在,可以幫助我(wǒ)們利用基因位置順序來預測基因調控關系和調控的時間順序.
方法:采用時空鄰域法研究了斑馬魚心髒發育階段的基因和miRNA,建立基因調控網絡(圖5),并通過進一(yī)步比較,得到了基因位置順序和基因調控時間順序的聯系.
結論:基因位置順序信息可以用于預測基因調控關系.

關鍵詞組：預測;基因調控關系;基因位置順序信息;時空鄰域法;斑馬魚心髒發育期

A finite element analysis of the stress distribution to the mandible from impact forces with various orientations of third molars

Yun-Feng Liu, Russell Wang, Dale A. Baur, Xian-Feng Jiang

DOI: 10.1631/jzus.B1600552 Downloaded: 2719 Clicked: 5138 Cited: 0 Commented: 0(p.38-48) <Full Text> <PPT> 1705

Chinese summary <17> 有限元方法分(fēn)析具有不同形态第三磨牙的下(xià)颌骨受到沖擊力時的應力分(fēn)布

目的:評估下(xià)颌骨在具有不同形态的第三磨牙或者沒有第三磨牙的情況下(xià),當遭受到前部或側部2000 N沖擊力時,其應力分(fēn)布.
創新點:第三磨牙的存在對下(xià)颌骨的力學性能有影響,而且不同位置形态的第三磨牙對下(xià)颌骨的力學性能的影響存在差異.
方法:根據一(yī)個具有完整牙列的健康下(xià)颌骨的計算機斷層掃描(CT)圖像構建出其三維模型,以CT圖像上的Hounsfield值(HU)爲基礎,計算出下(xià)颌骨的力學性能參數(包括密度和楊氏模量),共分(fēn)成9組數據.構建出第三磨牙分(fēn)别爲水平向、垂直向以及近中(zhōng)方向呈45度角時的完全阻生(shēng)和部分(fēn)阻生(shēng)的共6組下(xià)颌骨計算模型.并以無第三磨牙的下(xià)颌骨爲基準模型,利用有限元方法計算在下(xià)颌前部和側面分(fēn)别受到2000 N的靜态沖擊力的情況下(xià)Von Mises應力分(fēn)布.
結論:有限元分(fēn)析結果顯示,相同載荷條件下(xià),當第三磨牙部分(fēn)阻生(shēng)時的下(xià)颌骨髁突頸和角部區域的應力值比完全阻生(shēng)時要大(dà),因此具有部分(fēn)阻生(shēng)第三磨牙的下(xià)颌骨具有更高的骨折風險;當具有水平向部分(fēn)阻生(shēng)的第三磨牙時,下(xià)颌骨骨折的風險最大(dà).對于各種計算模型,下(xià)颌骨受到側向沖擊力時,應力最大(dà)位置均位于下(xià)颌角區;對于無第三磨牙的下(xià)颌骨,應力最大(dà)位置位于髁突頸部區域,此時髁突頸更容易發生(shēng)骨折.

關鍵詞組：有限元分(fēn)析;第三磨牙;下(xià)颌骨;生(shēng)物(wù)力學仿真

Electrocardiogram (ECG) patterns of left anterior fascicular block and conduction impairment in ventricular myocardium: a whole-heart model-based simulation study

Yuan Gao, Ling Xia, Ying-Lan Gong, Ding-Chang Zheng

DOI: 10.1631/jzus.B1700029 Downloaded: 2306 Clicked: 5823 Cited: 0 Commented: 0(p.49-56) <Full Text> <PPT> 1579

Chinese summary <18> 左前分(fēn)支傳導阻滞與心室肌傳導障礙心電圖研究:基于全心髒模型仿真

目的:探究左前分(fēn)支傳導阻滞與心室肌傳導速度減慢(màn)的體(tǐ)表心電圖之間相似之處,并探究其機理.
創新點:通過心電圖仿真,證明了左心室前壁傳導速度減慢(màn)會形成類似左前分(fēn)支阻滞的波形,并結合仿真心髒電興奮傳導時序,對其機理進行了合理解釋.
方法:将真實人體(tǐ)心髒通過64位螺旋計算機斷層掃描(CT),進行心髒解剖結構建模.通過單域模型仿真出全心髒電興奮的傳導時序,然後利用邊界元法計算出各時刻人體(tǐ)體(tǐ)表電位,進而計算出十二導聯心電圖.
結論:左心室前壁心肌細胞傳導速度的減慢(màn),會形成類似左前分(fēn)支阻滞的心電圖波形,其主要區别是QRS波群的時間跨度以及幅度大(dà)小(xiǎo).

關鍵詞組：心電圖;仿真;心髒建模;左前分(fēn)支阻滞

Effect of corticosteroids on atrial fibrillation after catheter ablation: a meta-analysis^#

Sanjay Jaiswal, Xian-bao Liu, Qu-cheng Wei, Ying-hao Sun, Li-han Wang, Liu-guang Song, Dan-dan Yang, Jian-an Wang

DOI: 10.1631/jzus.B1600529 Downloaded: 2216 Clicked: 4398 Cited: 0 Commented: 0(p.57-64) <Full Text> <PPT> 1616

Chinese summary <19> 皮質類固醇對導管消融術後心房顫動影響的荟萃分(fēn)析

目的:探讨皮質類固醇對導管消融術後心房顫動(AF)的影響.
創新點:首個探讨皮質類固醇對導管消融術後AF影響的荟萃分(fēn)析.
方法:我(wǒ)們在PubMed、Embase和Cochrane對照試驗中(zhōng)心注冊庫中(zhōng)搜索了描述皮質類固醇對預防導管消融後AF複發影響的文章,并提取了研究和患者的相關數據.使用随機效應模型計算風險比(RR)和95%置信區間(CI),P<0.05被認爲具有統計學差異.
結論:導管消融術圍術期皮質類固醇的使用與AF早期複發減少相關,但與晚期複發無關.

關鍵詞組：心房顫動;皮質類固醇;導管消融術;荟萃分(fēn)析

Activity of metalloproteinases and adiponectin in obese patients—a possible factor of incisional hernias after bariatric procedures

Wojciech Szczęsny, Magdalena Kuligowska-Prusińska, Stanisław Dąbrowiecki, Jakub Szmytkowski, Adrian Reśliński, Maciej Słupski

DOI: 10.1631/jzus.B1600383 Downloaded: 2062 Clicked: 4048 Cited: 0 Commented: 0(p.65-70) <Full Text> <PPT> 1389

Chinese summary <19> 肥胖患者體(tǐ)内金屬蛋白(bái)酶和脂聯素的活性-- 肥胖手術後造成切口疝的可能因素

目的:主要研究病态肥胖患者與正常人血清中(zhōng)金屬蛋白(bái)酶2(MMP-2)、MMP-9、MMP-13和脂聯素的濃度.
創新點:建立血清中(zhōng)MMP-2、MMP-9、MMP-13和脂聯素的濃度與肥胖和切口疝的關系.
方法:參與實驗的人員(yuán)爲進行肥胖手術的患者和不進行肥胖手術的患者,并将他們分(fēn)爲兩組:I(體(tǐ)重指數(BMI)≥35 kg/m²,n=40)和II(BMI<25 kg/m²,n=30),并使用酶聯免疫吸附實驗測定受試人員(yuán)體(tǐ)内血清中(zhōng)MMP-2、MMP-9、MMP-13和脂聯素的濃度.
結論:MMP-2的濃度在肥胖組中(zhōng)更高,且在兩組血清中(zhōng)有顯著性差異.雖然MMP-9的濃度在肥胖組中(zhōng)更高,但是兩組之間沒有顯著性差異.MMP-13在兩組間沒有差異.血清中(zhōng)脂聯素的濃度在非肥胖組更高,但無顯著性差異.因此,血清中(zhōng)MMP-2和MMP-9的濃度在肥胖人群中(zhōng)與更高的切口疝發病率有關.

關鍵詞組：金屬蛋白(bái)酶;脂聯素;肥胖症;切口疝

Complementary feeding patterns among ethnic groups in rural western China

Peng-fei Qu, Ya Zhang, Jia-mei Li, Ruo Zhang, Jiao-mei Yang, Fang-liang Lei, Shan-shan Li, Dan-meng Liu, Shao-nong Dang, Hong Yan

DOI: 10.1631/jzus.B1600504 Downloaded: 2169 Clicked: 4689 Cited: 0 Commented: 0(p.71-78) <Full Text> <PPT> 1563

Chinese summary <20> 中(zhōng)國西部農村(cūn)地區嬰幼兒輔食喂養狀況民族差異的調查

目的:比較中(zhōng)國西部農村(cūn)地區四個民族(漢、維、藏和壯)的嬰幼兒的輔食喂養狀況,探讨影響嬰幼兒輔食喂養的影響因素.
創新點:在中(zhōng)國西部10省區開(kāi)展大(dà)規模人群流行病學調查,對比分(fēn)析西部農村(cūn)地區四個主要民族(漢、維、藏和壯)的嬰幼兒的輔食添加的時間、類别、頻(pín)率及質量,探讨其差異的可能原因,以及研究影響西部農村(cūn)地區輔食喂養的可控因素,爲西部農村(cūn)地區不同民族改善嬰幼兒輔食喂養狀況提供幹預措施.
方法:采用人口比例抽樣法,在2005年調查西部10省區45縣9172個6~35個月的嬰幼兒的輔食添加狀況(7411漢、1032維、678藏和591壯),構建了适合西部地區的嬰幼兒喂養指數(ICFI),綜合評價嬰幼兒輔食喂養質量.
結論:漢族和壯族嬰幼兒的喂養質量好于維族和藏族.母親教育水平、家庭經濟水平和喂養宣傳是影響嬰幼兒輔食喂養質量的重要因素,合理的幹預措施是促進西部地區嬰幼兒輔食添加質量的關鍵.

關鍵詞組：輔食喂養;嬰幼兒喂養指數;多民族;中(zhōng)國西部地區

Correspondence

Physical interactions and mutational analysis of MoYpt7 in Magnaporthe oryzae

Lu-Yao Huang, Min Wu, Xiao-Yun Yu, Lin Li, Fu-Cheng Lin, Xiao-Hong Liu

DOI: 10.1631/jzus.B1700336 Downloaded: 1964 Clicked: 4345 Cited: 0 Commented: 0(p.79-84) <Full Text> <PPT> 1411

Chinese summary <18> 稻瘟病菌MoYpt7互作蛋白(bái)和點突變的研究

目的:研究MoYpt7與MoGdi1的互作關系以及定點突變體(tǐ)MoYpt7^N125I的生(shēng)物(wù)學功能.
創新點:補充了MoYpt7在稻瘟病菌緻病過程中(zhōng)的生(shēng)物(wù)學功能.
方法:采用雙分(fēn)子熒光互補和免疫共沉澱的方法檢測MoYpt7與MoGdi1的相互作用.利用點突變的方法,分(fēn)析MoYpt7的鳥嘌呤二核苷酸磷酸(GDP)結合形式的生(shēng)物(wù)學功能.
結論:MoYpt7與Rab-GDP解離(lí)抑制因子的一(yī)個同源物(wù)MoGdi1相互作用,獲得了MoYpt7的GDP結合形式的過表達突變體(tǐ).該突變體(tǐ)菌落形态發生(shēng)變化,産孢能力和緻病性顯著下(xià)降.同時,稻瘟病菌MoYpt7^N125I的亞細胞定位發生(shēng)變化.

關鍵詞組：雙分(fēn)子熒光互補;免疫沉澱;MoGdi1;MoYpt7