Journal of Zhejiang University

Current Issue: <JZUS-B>

Journal of Zhejiang University-SCIENCE B (Biomedicine & Biotechnology)

ISSNs 1673-1581 (Print); 1862-1783 (Online); CN 33-1356/Q; started in 2005,Monthly.

JZUS-B is an international "Biomedicine & Biotechnology" reviewed-Journal indexed by SCI-E, MEDLINE, PMC, BA, BIOSIS Previews, JST, ZR, CA, SA, AJ, ZM, CABI, CSA, etc., and supported by the National Natural Science Foundation of China. It mainly covers research in Biomedicine, Biochemistry and Biotechnology, etc.

Impact factor: 1.099 (2011), 1.108 (2012), 1.293 (2013), 1.278 (2014), 1.303 (2015), 1.676 (2016), 1.815 (2017), 1.879 (2018).

Journal of Zhejiang University SCIENCE B

ISSN 1673-1581(Print), 1862-1783(Online), Monthly

2024 Vol.25 No.4 P.271-360

Cover:

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Contents:

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<<< CONTENTS >>>

Reviews

Review: Impacts of pancreatic exocrine insufficiency on gut microbiota

Yulin GUO, Feng CAO, Fei LI

DOI: 10.1631/jzus.B2300070 Downloaded: 350 Clicked: 468 Cited: 0 Commented: 0(p.271-279) <Full Text> <PPT> 45

Chinese summary <11> 胰腺外(wài)分(fēn)泌功能不全對腸道微生(shēng)物(wù)群的影響

郭玉霖^1,2，曹鋒^1,2，李非^1,2
¹首都醫科大(dà)學宣武醫院普通外(wài)科，中(zhōng)國北(běi)京市，100053
²首都醫科大(dà)學急性胰腺炎臨床診療中(zhōng)心，中(zhōng)國北(běi)京市，100053
摘要：胰腺外(wài)分(fēn)泌功能不全（PEI）可由多種疾病引起，包括慢(màn)性胰腺炎、急性胰腺炎、胰腺切除術後等。PEI其主要發病機制與胰蛋白(bái)酶合成下(xià)降、胰液流動紊亂、分(fēn)泌反饋失衡有關。動物(wù)研究表明：PEI可誘導腸道細菌過度生(shēng)長和生(shēng)态失調，其中(zhōng)乳杆菌和雙歧杆菌的豐度增加最爲多見；腸道細菌過度生(shēng)長和生(shēng)态失調可通過胰酶替代治療得到部分(fēn)逆轉。臨床研究也證實PEI與腸道菌群失調之間存在關聯。胰髒外(wài)分(fēn)泌水平的下(xià)降，伴随PEI産生(shēng)的十二指腸pH值的改變，以及PEI引起的膽鹽吸收不良，這可能是PEI導緻腸道菌群豐度和組成發生(shēng)改變的潛在作用機制。反之，腸道微生(shēng)物(wù)群也可能通過潛在的雙向調節影響胰腺外(wài)分(fēn)泌腺泡的功能。展望未來，仍需要更多的高質量研究來揭示胰腺外(wài)分(fēn)泌不足對腸道微生(shēng)物(wù)群影響的機制。

關鍵詞組：胰腺外(wài)分(fēn)泌不足；腸道微生(shēng)物(wù)群；腸道微生(shēng)物(wù)組；胰酶替代療法

Review: Emerging role of lncRNAs as mechanical signaling molecules in mechanotransduction and their association with Hippo-YAP signaling: a review

Siyi LIN, Xinyu HE, Ying WANG, Yu CHEN, Aifu LIN

DOI: 10.1631/jzus.B2300497 Downloaded: 256 Clicked: 275 Cited: 0 Commented: 0(p.280-292) <Full Text> <PPT> 61

Chinese summary <4> LncRNAs在機械轉導中(zhōng)的作用及其與Hippo-YAP信号轉導的關聯

林思怡¹，何欣豫^2,3,4，王穎^2,3,4，陳妤^2,3,4，林愛福^2,3,4,5,6,7
¹浙江大(dà)學醫學院，中(zhōng)國杭州市，310058
²浙江大(dà)學生(shēng)命科學學院，中(zhōng)國杭州市，310058
³浙江大(dà)學癌症研究院，中(zhōng)國杭州市，310058
⁴浙江省細胞與基因工(gōng)程重點實驗室，中(zhōng)國杭州市，310058
⁵浙江大(dà)學醫學院附屬第四醫院國際醫學院，中(zhōng)國義烏市，322000
⁶惡性腫瘤預警與幹預教育部重點實驗室，中(zhōng)國杭州市，310058
⁷浙江大(dà)學長三角智慧綠洲創新中(zhōng)心，中(zhōng)國嘉興市，314100
摘要：細胞在組織中(zhōng)受到各種機械力的作用，包括靜水壓力、剪切應力、壓縮和張力。這些機械刺激可通過機械感受器或細胞骨架依賴性反應過程轉化爲生(shēng)化信号，從而塑造微環境，并維持細胞生(shēng)理平衡。研究已證實轉錄共激活因子YAP/TAZ可作爲機械轉導因子，對細胞表型（如分(fēn)化和疾病發病）産生(shēng)動态影響。這種調節功能涉及細胞骨架、核骨架、整合素、局竈黏附蛋白(bái)（FA），以及多種信号通路的整合，包括細胞外(wài)信号調節蛋白(bái)激酶（ERK）、WNT和Hippo信号通路。此外(wài)，最新研究表明長鏈非編碼RNA（lncRNA）可作爲機械敏感分(fēn)子在機械轉導過程中(zhōng)發揮作用。本綜述讨論了YAP/TAZ和lncRNA響應機械刺激的機制，并總結了參與機械轉導的關鍵信号分(fēn)子。

關鍵詞組：YAP/TAZ；長鏈非編碼RNA（lncRNA）；機械轉導；F-肌動蛋白(bái)

Research Articles

Unlocking the growth potential: harnessing the power of synbiotics to enhance cultivation of Pleurotus spp.

Reshma PATIL, Aizi Nor Mazila RAMLI, Ang Shu XUAN, Ng Zhi XIN, Nur Izyan Wan AZELEE, Prakash BHUYAR

DOI: 10.1631/jzus.B2300383 Downloaded: 274 Clicked: 375 Cited: 0 Commented: 0(p.293-306) <Full Text> <PPT> 63

Chinese summary <6> 釋放(fàng)生(shēng)長潛力：利用合生(shēng)元的力量加強側耳屬植物(wù)種植

Reshma PATIL^1,2，Aizi Nor Mazila RAMLI^1,2，Ang Shu XUAN¹，Ng Zhi XIN¹，Nur Izyan Wan AZELEE³，Prakash BHUYAR^4,5
¹馬來西亞彭亨蘇丹阿蔔杜拉大(dà)學工(gōng)業科學與技術學院（UMPSA），馬來西亞甘孟市，26300
²Bio芳香卓越研究中(zhōng)心，馬來西亞彭亨蘇丹阿蔔杜拉大(dà)學，馬來西亞甘孟市，26300
³馬來西亞工(gōng)藝大(dà)學工(gōng)程學院生(shēng)物(wù)工(gōng)藝與聚合物(wù)工(gōng)程系，馬來西亞新山市，81310
⁴梅州大(dà)學國際學院有機農業管理（MJU-IC），泰國清邁市，50290
⁵梅州大(dà)學國際學院國際工(gōng)農業創新研究中(zhōng)心（IIAR），泰國清邁市，50290
摘要：平菇（Pleurotus spp.）是全球最廣泛栽培的蘑菇品種之一(yī)。本研究旨在探讨合生(shēng)元對Pleurotus ostreatus和Pleurotus pulmonarius生(shēng)長和品質的影響。通過每日對蘑菇樣品噴灑不同濃度的合生(shēng)元，測量其生(shēng)長參數、産量、生(shēng)物(wù)效率、近似成分(fēn)、礦物(wù)質含量、總酚含量和二苯基-1-三硝基苯肼（DPPH）自由基清除活性。結果表明，使用噴灑菊粉和幹酪乳杆菌的合生(shēng)元，平菇的産量最高（56.92克），生(shēng)物(wù)效率也最高（12.65%）。菊粉和幹酪乳杆菌的組合最爲高效，可以同時提高兩種樣品蘑菇的生(shēng)長性能和營養成分(fēn)。此外(wài)在白(bái)平菇（P. ostreatus）中(zhōng)，菊粉和幹酪乳杆菌組合的合生(shēng)元可産生(shēng)最高的總酚含量（20.550 mg GAE/g DE），而在灰蘑菇（P. pulmonarius）中(zhōng)産生(shēng)最高總酚含量的是幹酪乳杆菌（1.098 mg GAE/g DE），其次是菊粉和幹酪乳杆菌（1.079 mg GAE/g DE）。DPPH結果表明，平菇可以作爲一(yī)種有效的抗氧化劑。綜上，合生(shēng)元可通過增加酚類化合物(wù)的含量來提高蘑菇的抗氧化能力，并通過增加礦物(wù)質元素的含量來提供更好的健康益處，從而提高了蘑菇的品質。上述研究證明了合生(shēng)元作爲一(yī)種生(shēng)物(wù)肥料用于蘑菇栽培的應用潛力，是幫助蘑菇種植者解決質量不穩定的一(yī)個有效方案。

關鍵詞組：抗氧化劑；生(shēng)物(wù)肥料；成長表現；蘑菇種植；側耳屬；合生(shēng)元

Nrf2-mediated ferroptosis of spermatogenic cells involved in male reproductive toxicity induced by polystyrene nanoplastics in mice

Xufeng FU, Hang HAN, Hong YANG, Bo XU, Wenjie DAI, Ling LIU, Tiantian HE, Xing DU, Xiuying PEI

DOI: 10.1631/jzus.B2300138 Downloaded: 352 Clicked: 580 Cited: 0 Commented: 0(p.307-323) <Full Text> <PPT> 71

Chinese summary <7> Nrf2介導的生(shēng)精細胞鐵死亡參與了聚苯乙烯納米塑料導緻的小(xiǎo)鼠雄性生(shēng)殖毒性

付旭鋒^1,2，韓杭¹，楊宏¹，許博¹，代文傑¹，劉玲¹，何甜甜¹，杜星¹，裴秀英^1,2
¹甯夏醫科大(dà)學生(shēng)育力保持教育部重點實驗室，中(zhōng)國銀川市，750004
²甯夏生(shēng)殖與遺傳學重點實驗室，中(zhōng)國銀川市，750004
摘要：由于大(dà)量塑料廢棄物(wù)的排放(fàng)和一(yī)次性口罩的廣泛使用，所産生(shēng)的微塑料（MPs）和納米塑料（NPs）已被認爲是有害物(wù)質，但它們對健康的具體(tǐ)影響仍不确定。本研究将熒光标記的聚苯乙烯納米塑料（PS-NPs）注射到小(xiǎo)鼠體(tǐ)内以确定NPs在體(tǐ)内的分(fēn)布和潛在的毒性作用，通過動物(wù)活體(tǐ)成像發現PS-NPs在小(xiǎo)鼠睾丸中(zhōng)有明顯積累。因此，本文研究了PS-NPs對雄性小(xiǎo)鼠生(shēng)殖系統和對生(shēng)精細胞的毒性作用及機制。通過雄性小(xiǎo)鼠灌胃暴露50 nm和90 nm的PS-NPs後，其生(shēng)精能力受到影響且生(shēng)精細胞受損；在體(tǐ)外(wài)暴露發現，PS-NPs會影響精母細胞系GC-2的存活；利用RNA-seq進一(yī)步分(fēn)析其毒理機制，發現PS-NPs通過鐵死亡途徑影響GC-2細胞；通過線粒體(tǐ)形态、Fe²⁺水平、脂質過氧化、線粒體(tǐ)膜電位和不穩定鐵等方面評價了PS-NPs引起GC-2細胞鐵死亡的表型，進一(yī)步明确鐵死亡抑制劑Fer-1可以逆轉鐵死亡表型。随後，發現Nrf2在PS-NPs誘導GC-2細胞鐵死亡中(zhōng)起重要作用，并且抑制Nrf2後可加劇PS-NPs誘導的GC-2細胞鐵死亡。最後，通過體(tǐ)内實驗進一(yī)步證實了Nrf2在PS-NPs誘導的雄性生(shēng)殖毒性中(zhōng)發揮保護作用。因此，本研究表明，PS-NPs通過引起Nrf2介導的生(shēng)精細胞鐵死亡進而導緻小(xiǎo)鼠雄性生(shēng)殖功能障礙。

關鍵詞組：聚苯乙烯納米塑料（PS-NPs）；雄性生(shēng)殖毒性；鐵死亡；核因子e2相關因子2（Nrf2）

Large-scale genome-wide SNP analysis reveals the rugged (and ragged) landscape of global ancestry, phylogeny, and demographic history in chicken breeds

Natalia V. DEMENTIEVA, Yuri S. SHCHERBAKOV, Olga I. STANISHEVSKAYA, Anatoly B. VAKHRAMEEV, Tatiana A. LARKINA, Artem P. DYSIN, Olga A. NIKOLAEVA, Anna E. RYABOVA, Anastasiia I. AZOVTSEVA, Olga V. MITROFANOVA, Grigoriy K. PEGLIVANYAN, Natalia R. REINBACH, Darren K. GRIFFIN, Michael N. ROMANOV

DOI: 10.1631/jzus.B2300443 Downloaded: 297 Clicked: 393 Cited: 0 Commented: 0(p.324-340) <Full Text> <PPT> 49

Chinese summary <5> 大(dà)規模全基因組SNP分(fēn)析揭示了雞品種的全球祖先、種群發展和種群曆史的複雜(zá)(和多樣)的遺傳圖譜

Natalia V. DEMENTIEVA¹, Yuri S. SHCHERBAKOV¹, Olga I. STANISHEVSKAYA¹, Anatoly B. VAKHRAMEEV¹,Tatiana A. LARKINA¹, Artem P. DYSIN¹, Olga A. NIKOLAEVA¹, Anna E. RYABOVA¹, Anastasiia I. AZOVTSEVA¹,Olga V. MITROFANOVA¹, Grigoriy K. PEGLIVANYAN¹, Natalia R. REINBACH¹, Darren K. GRIFFIN²,Michael N. ROMANOV^2,3
¹Russian Research Institute of Farm Animal Genetics and Breeding - Branch of the L. K. Ernst Federal Research Centre for Animal Husbandry, Pushkin, St. Petersburg, 196601, Russia
²School of Biosciences, University of Kent, Canterbury, CT2 7NJ, UK
³L. K. Ernst Federal Research Center for Animal Husbandry, Dubrovitsy, Podolsk, Moscow Oblast, 142132, Russia
摘要：全球範圍内的雞品種基因庫中(zhōng)涵蓋了數量龐大(dà)且多樣化起源的多種品系，不過這個數量正逐漸減少。本研究采用了大(dà)規模的全基因組分(fēn)析，探究了49個種群的複雜(zá)分(fēn)子結構、遺傳變異性以及詳細結構組成。這些種群來自于歐洲（如俄羅斯、捷克共和國、法國、西班牙、英國等）、亞洲（如中(zhōng)國）、北(běi)美（如美國）和大(dà)洋洲（如澳大(dà)利亞），代表了世界各地的雞品種。我(wǒ)們使用Illumina 60K單核苷酸多态性（SNP）芯片對品種進行了基因型分(fēn)析，然後進行了生(shēng)物(wù)信息學分(fēn)析。這一(yī)分(fēn)析包括了雜(zá)合子/純合子統計、近交系數和有效種群大(dà)小(xiǎo)的計算，以及連鎖不平衡的評估和系統發生(shēng)樹(shù)的構建。通過多維縮放(fàng)、主成分(fēn)分(fēn)析和ADMIXTURE輔助全球祖先分(fēn)析，我(wǒ)們探索了每個品種種群和亞群的遺傳結構。此外(wài)，還進行了總體(tǐ)的49個種群的系統發生(shēng)分(fēn)析，并提出了一(yī)種精細化的雞品種形成演化模型，其中(zhōng)包括蛋、肉、兼用型和混合的品種。利用現代基因組方法對家禽養殖中(zhōng)的遺傳資(zī)源進行如此大(dà)規模的調查，不僅對于普遍了解家雞遺傳學的角度具有重要意義，而且對于進一(yī)步發展家禽育種中(zhōng)的基因組技術和方法也是至關重要的。總而言之，對來自全球基因庫的有發展潛力的雞品種進行全基因組SNP基因分(fēn)型，将促進現代基因組學在家禽育種中(zhōng)的進一(yī)步發展。

關鍵詞組：雞基因組多樣性；單核苷酸多态性分(fēn)析（SNP)；基因庫；全球原始祖先；種群發展史；種群大(dà)小(xiǎo)曆史

ELABELA-derived peptide ELA13 attenuates kidney fibrosis by inhibiting the Smad and ERK signaling pathways

Zhibin YAN, Ying SHI, Runling YANG, Jijun XUE, Caiyun FU

DOI: 10.1631/jzus.B2300033 Downloaded: 116 Clicked: 192 Cited: 0 Commented: 0(p.341-353) <Full Text> <PPT> 59

Chinese summary <8> ELABELA衍生(shēng)肽ELA13通過抑制Smad和ERK信号通路減輕腎纖維化

闫志(zhì)斌¹，史影²，楊潤玲³，薛吉軍²，付彩雲^1,3
¹浙江理工(gōng)大(dà)學生(shēng)命科學與醫藥學院，浙江省家蠶生(shēng)物(wù)反應器和生(shēng)物(wù)醫藥重點實驗室，中(zhōng)國杭州市，310018
²蘭州大(dà)學化學化工(gōng)學院，功能有機分(fēn)子化學國家重點實驗室，中(zhōng)國蘭州市，730000
³蘭州大(dà)學甘肅省新藥臨床前研究重點實驗室，中(zhōng)國醫學科學院多肽研究創新單元（2019RU066），中(zhōng)國蘭州市，730000
摘要：腎髒纖維化是各種慢(màn)性腎髒疾病發展爲終末期腎病的關鍵過程。目前尚無針對腎纖維化的特異性治療方法。ELA13（氨基酸序列：RRCMPLHSRVPFP）是ELABELA在所有脊椎動物(wù)中(zhōng)的保守片段，目前對其生(shēng)物(wù)學活性的研究卻很少。本研究評估了ELA13對轉化生(shēng)長因子β1（TGF-β1）處理的NRK-52E細胞和單側輸尿管閉塞（UUO）小(xiǎo)鼠的作用效果。首先，體(tǐ)外(wài)實驗表明在TGF-β1誘導的NRK-52E細胞中(zhōng)，ELA13可以降低纖維化标志(zhì)物(wù)I型膠原（Collagen I）、纖連蛋白(bái)（fibronectin）和α-平滑肌肌動蛋白(bái)（α-SMA）的表達水平。随後，在UUO誘導的小(xiǎo)鼠腎纖維化模型中(zhōng)，我(wǒ)們發現ELA13可以通過降低血清中(zhōng)肌酐和尿素氮的含量來改善腎功能，并通過Masson染色、免疫組織化學、實時定量聚合酶鏈式反應（RT-PCR）和蛋白(bái)質印迹（western blot）的結果證實纖維化标志(zhì)物(wù)和炎症标志(zhì)物(wù)的表達降低了。進一(yī)步機制研究發現，ELA13處理可抑制Smad和細胞外(wài)調節蛋白(bái)激酶（ERK）信号通路。綜上所述，ELA13通過抑制Smad和ERK信号通路發揮抗腎纖維化的作用，有望成爲抗腎纖維化治療的候選分(fēn)子。

關鍵詞組：ELA13；腎纖維化；炎症反應；Smad；細胞外(wài)調節蛋白(bái)激酶（ERK）

Correspondence

Correspondence: Seizure as the main presenting manifestation of three patients with acute glufosinate-ammonium poisoning

Ping WANG, Congying SONG, Xuan LU, Yuanqiang LU

DOI: 10.1631/jzus.B2300469 Downloaded: 245 Clicked: 349 Cited: 0 Commented: 0(p.354-358) <Full Text> <PPT> 40

Chinese summary <4> 三例以癫痫爲主要表現的急性草铵膦中(zhōng)毒患者的病例報告

王萍^1,2，宋聰穎^1,2，陸璇^2,3，陸遠強^1,2
¹浙江大(dà)學醫學院附屬第一(yī)醫院急診科，中(zhōng)國杭州市，310003
²浙江省增齡與理化損傷性疾病診治研究重點實驗室，中(zhōng)國杭州市，310003
³浙江大(dà)學醫學院附屬第一(yī)醫院老年科，中(zhōng)國杭州市，310003
摘要：草铵膦作爲谷氨酸（Glu）的結構類似物(wù)，可以不可逆地抑制植物(wù)中(zhōng)谷氨酰胺合成酶（GS）和谷氨酸脫羧酶活性，從而阻止谷氨酰胺（Gln）生(shēng)成，最終導緻植物(wù)因氮代謝紊亂和細胞内氨積累而死亡。人誤服草胺磷後也會出現相應的中(zhōng)毒症狀，包括胃腸道症狀和神經毒性。草铵膦作爲最常見的緻癫痫類除草劑，且無特定解毒劑，因此支持性治療至關重要。在臨床診治過程中(zhōng)，如何及時有效識别草铵膦除草劑引起的神經毒性并提供适當治療尤爲關鍵。本文介紹了我(wǒ)院三名草铵膦中(zhōng)毒患者的主要症狀，其中(zhōng)癫痫是主要的神經表現。随後，通過查閱相關文獻，對草铵膦引發神經毒性的相關機制進行了總結，并讨論了神經毒性的預測和檢測方法。

關鍵詞組：草铵膦；癫痫；除草劑中(zhōng)毒；頭部CT

Errata

Erratum: Erratum to: Bioinformatic analysis for potential biological processes and key targets of heart failure-related stroke

Chiyu LIU, Sixu CHEN, Haifeng ZHANG, Yangxin CHEN, Qingyuan GAO, Zhiteng CHEN, Zhaoyu LIU, Jingfeng WANG

DOI: 10.1631/jzus.B20e0544 Downloaded: 45 Clicked: 94 Cited: 0 Commented: 0(p.359-359) <Full Text>

Erratum: Erratum to: Molecular dynamics simulation reveals DNA-specific recognition mechanism via c-Myb in pseudo-palindromic consensus of mim-1 promoter

Jinru WENG, Shuo YANG, Jinkang SHEN, Hongsen LIU, Yuzi XU, Dongyun HAO, Shan WANG

DOI: 10.1631/jzus.B22e0634 Downloaded: 51 Clicked: 85 Cited: 0 Commented: 0(p.360-360) <Full Text>