Journal of Zhejiang University

Current Issue: <JZUS-B>

Journal of Zhejiang University-SCIENCE B (Biomedicine & Biotechnology)

ISSNs 1673-1581 (Print); 1862-1783 (Online); CN 33-1356/Q; started in 2005,Monthly.

JZUS-B is an international "Biomedicine & Biotechnology" reviewed-Journal indexed by SCI-E, MEDLINE, PMC, BA, BIOSIS Previews, JST, ZR, CA, SA, AJ, ZM, CABI, CSA, etc., and supported by the National Natural Science Foundation of China. It mainly covers research in Biomedicine, Biochemistry and Biotechnology, etc.

Impact factor: 1.099 (2011), 1.108 (2012), 1.293 (2013), 1.278 (2014), 1.303 (2015), 1.676 (2016), 1.815 (2017), 1.879 (2018).

Journal of Zhejiang University SCIENCE B

ISSN 1673-1581(Print), 1862-1783(Online), Monthly

2019 Vol.20 No.6 P.457-540

<<< CONTENTS >>>

Special Issue (Part II) for the 90th Anniversary of College of Life Sciences, Zhejiang University

Guest Editors-in-Chief: Jin-rong PENG, Kun-liang GUAN, De-yuan HONG, Xin-hua LIN, Huan-ming YANG, Yu-xian ZHU

Guest Editors: Ai-fu LIN, Lu-yang YU, Bin ZHAO

Reviews

p53 and its isoforms in DNA double-stranded break repair

Yu-Xi Zhang, Wen-Ya Pan, Jun Chen

DOI: 10.1631/jzus.B1900167 Downloaded: 1959 Clicked: 3678 Cited: 0 Commented: 0(p.457-466) <Full Text> <PPT> 1266

Chinese summary <23> p53及其異構體(tǐ)在DNA雙鏈斷裂修複中(zhōng)的作用

概要:DNA雙鏈斷裂是DNA損傷最嚴重的形式.如果DNA斷裂不能正确修複,将會導緻遺傳物(wù)質的丢失、基因突變和染色體(tǐ)重排.這不僅會影響正常的發育和衰老過程,而且更嚴重的是基因組的不完整會導緻人類容易患上免疫缺陷、神經系統紊亂和癌症等疾病.抑癌基因p53在DNA損傷反應中(zhōng)扮演着一(yī)個中(zhōng)心角色,超過50%以上的人類癌細胞中(zhōng)p53發生(shēng)了變異.p53家族包括p53、p63和p73三個成員(yuán).近年來研究發現:人的p53基因最少編碼12個異構體(tǐ),這些異構體(tǐ)在DNA損傷反應中(zhōng)起着不同作用,并協同p53一(yī)起維持基因組DNA的完整性.本綜述将探讨p53及其異構體(tǐ)在DNA雙鏈斷裂修複中(zhōng)的作用.

關鍵詞組：p53;p53異構體(tǐ);DNA雙鏈斷裂修複;細胞死亡

Novel insights into cell cycle regulation of cell fate determination

Su-Wei Gao, Feng Liu

DOI: 10.1631/jzus.B1900197 Downloaded: 2100 Clicked: 3407 Cited: 0 Commented: 0(p.467-475) <Full Text>

Chinese summary <25> 細胞周期調控細胞命運決定的新見解

概要:長期以來,幹/祖細胞由于其具備的自我(wǒ)更新和多譜系分(fēn)化能力,因而被視爲生(shēng)物(wù)體(tǐ)發育、穩态和再生(shēng)過程中(zhōng)的一(yī)類重要細胞類型.幹/祖細胞自我(wǒ)更新和多譜系分(fēn)化之間的平衡是由細胞周期進程和細胞命運決定之間的協同調控來完成的.大(dà)量研究表明細胞周期狀态可以決定細胞的命運,體(tǐ)現在處于不同細胞周期狀态的細胞具有不同的分(fēn)子特征和功能.目前,随着高分(fēn)辨率的表觀基因組學、單細胞轉錄組學和細胞周期實時标記系統的開(kāi)發,我(wǒ)們對細胞周期如何調控細胞命運有了新的認識.本文總結了細胞周期調控細胞命運決定和功能異質性的分(fēn)子機制,以及通過操縱細胞周期進而影響細胞命運轉變的研究進展.這些發現将加深我(wǒ)們對細胞周期調控細胞命運決定機制的理解,同時也能促進其在轉化醫學中(zhōng)的潛在應用.

關鍵詞組：細胞周期;細胞命運;異質性;命運轉變;幹/祖細胞

Genomic data mining for functional annotation of human long noncoding RNAs

Brian L. Gudenas, Jun Wang, Shu-Zhen Kuang, An-Qi Wei, Steven B. Cogill, Liang-Jiang Wang

DOI: 10.1631/jzus.B1900162 Downloaded: 1888 Clicked: 4291 Cited: 0 Commented: 0(p.476-487) <Full Text> <PPT> 1373

Chinese summary <20> 利用基因組數據挖掘對人類長非編碼RNA進行功能注釋

概要:越來越多證據表明RNA在生(shēng)物(wù)系統中(zhōng)扮演着重要的角色,而這些發現支持了生(shēng)命起源于RNA的假設.在人類基因組中(zhōng),大(dà)部分(fēn)的基因并不編碼蛋白(bái)質,被稱爲非編碼RNA基因.長非編碼RNA(lncRNA)是其中(zhōng)最大(dà)的一(yī)類,其轉錄本長度大(dà)于200個核苷酸.雖然一(yī)些lncRNA已被證明是調控基因表達和3D基因組結構的重要元件,但是大(dà)部分(fēn)lncRNA還未被研究和注釋.本課題組利用大(dà)量基因組數據,提出一(yī)些基于數據挖掘和機器學習的方法,對人類lncRNA進行功能注釋.我(wǒ)們與其他同領域課題組的近期研究結果表明,基因組數據挖掘可幫助加深對lncRNA功能的理解,并爲與疾病相關lncRNA的實驗研究提供重要信息.

關鍵詞組：長非編碼RNA(lncRNA);功能注釋;基因組數據挖掘;機器學習

Exosomal long non-coding RNAs: biological properties and therapeutic potential in cancer treatment

Jie Luo, Yan Xiong, Pei-Fen Fu, En-Chun Li, Lei Qu, Xiao Fan, Zhi-Jian Cai, Ai-Fu Lin

DOI: 10.1631/jzus.B1900039 Downloaded: 2138 Clicked: 3757 Cited: 0 Commented: 0(p.488-495) <Full Text> <PPT> 1562

Chinese summary <22> 外(wài)泌體(tǐ)lncRNA研究進展及其腫瘤靶向潛質

概要:外(wài)泌體(tǐ)和長鏈非編碼RNA(lncRNA)與腫瘤等危害人類健康重大(dà)疾病的發生(shēng)發展密切相關.對外(wài)泌體(tǐ)中(zhōng)lncRNA研究的深入解析有助于人們更加全面地了解癌症發生(shēng)發展機理機制,并有助于爲進一(yī)步腫瘤精準靶向治療提供新的潛在标志(zhì)物(wù)及臨床靶點.本綜述闡述了外(wài)泌體(tǐ)的發生(shēng)過程及其内容lncRNA,并進一(yī)步通過深入總結外(wài)泌體(tǐ)lncRNA在腫瘤臨床藥物(wù)耐受中(zhōng)的作用,評估其腫瘤靶向潛質,揭示其作爲潛在有效靶向治療靶點和診療标志(zhì)物(wù)的前景意義.

關鍵詞組：外(wài)泌體(tǐ);長鏈非編碼RNA(lncRNA);生(shēng)物(wù)合成;生(shēng)物(wù)标志(zhì)物(wù);腫瘤靶點;臨床耐藥

On the necessity of an integrative approach to understand protein structural dynamics

Qing-fen Yang, Chun Tang

DOI: 10.1631/jzus.B1900135 Downloaded: 1763 Clicked: 4073 Cited: 0 Commented: 0(p.496-502) <Full Text> <PPT> 1257

Chinese summary <20> 整合方法研究蛋白(bái)質結構動态之必要性

概要:蛋白(bái)質是動态的,在多種結構狀态間轉化.蛋白(bái)質的結構動态在時間和空間上跨越多個數量級,允許蛋白(bái)質執行特定生(shēng)物(wù)學功能.細胞條件和細胞環境的變化會使蛋白(bái)質動态結構發生(shēng)變化.因此,對蛋白(bái)質結構動态的全面表征可提供對蛋白(bái)質功能的機制的深入了解.在這裏,我(wǒ)們綜述了用于測定蛋白(bái)質系綜動态結構和表征蛋白(bái)質結構動态變化的方法的最新發展.X射線晶體(tǐ)學、冷凍電鏡和小(xiǎo)角散射等技術可提供關于蛋白(bái)質特定狀态或平均的結構信息,而核磁共振、熒光共振能量轉移(FRET)和化學交聯質譜等技術則提供了蛋白(bái)質結構域、蛋白(bái)質殘基和原子之間的處于不同結構狀态時的距離(lí)波動信息.尤其要指出的是,單分(fēn)子水平的FRET測量能對蛋白(bái)質構象狀态進行快速區分(fēn),而這樣的信息會在其它測量中(zhōng)被掩蓋.總之,不同的生(shēng)物(wù)物(wù)理技術互爲補充,隻有通過它們的綜合運用,才能清晰可見蛋白(bái)質結構和動态.

關鍵詞組：結構動态;整合結構生(shēng)物(wù)學;距離(lí)約束;系綜平均;核磁共振

Pericarp and seed of litchi and longan fruits: constituent, extraction, bioactive activity, and potential utilization

Xiang-Rong Zhu, Hui Wang, Jian Sun, Bao Yang, Xue-Wu Duan, Yue-Ming Jiang

DOI: 10.1631/jzus.B1900161 Downloaded: 2009 Clicked: 4601 Cited: 0 Commented: 0(p.503-512) <Full Text> <PPT> 1604

Chinese summary <22> 荔枝、龍眼的果皮和種子:成分(fēn)、提取、生(shēng)物(wù)活性和潛在利用

概要:荔枝(Litchi chinensis Sonn.)和龍眼(Dimocarpus longan Lour.)果肉白(bái)色透明,深受消費(fèi)者歡迎.荔枝和龍眼果實作爲我(wǒ)國傳統中(zhōng)草藥,可用于緩解神經疼痛和腫脹.荔枝和龍眼的果皮和種子部分(fēn)占整個果實幹重約30%,含有豐富的生(shēng)物(wù)活性物(wù)質.近年來研究發現,荔枝和龍眼的果皮和種子的提取物(wù)具有抑制酪氨酸酶活性、抗炎、免疫調節、抗糖化、抗癌以及增強記憶等功能.随着荔枝和龍眼果實在世界上種植面積和數量的迅速增加,加強對生(shēng)物(wù)活性物(wù)質的利用尤其必要.本文綜述了對荔枝和龍眼的果皮和種子中(zhōng)生(shēng)物(wù)活性化合物(wù)的鑒定、提取和藥理活性等方面研究的最新進展,并讨論了其資(zī)源潛在利用以及未來研究方向.

關鍵詞組：活性物(wù)質;提取;荔枝;龍眼;藥理活性;利用

Mechanisms and regulation of aluminum-induced secretion of organic acid anions from plant roots

Jian-Li Yang, Wei Fan, Shao-Jian Zheng

DOI: 10.1631/jzus.B1900188 Downloaded: 1843 Clicked: 3405 Cited: 0 Commented: 0(p.513-527) <Full Text> <PPT> 1414

Chinese summary <23> 鋁誘導植物(wù)根系分(fēn)泌有機酸陰離(lí)子的機理及其調控

概要:鋁是地殼中(zhōng)最豐富的金屬元素.在pH低于5.5的酸性土壤中(zhōng),部分(fēn)含鋁礦物(wù)中(zhōng)的鋁會溶解進入土壤溶液,嚴重危害植物(wù)的生(shēng)長和發育.一(yī)些植物(wù)能夠進化出耐鋁機理以制抵抗鋁毒害.其中(zhōng),鋁誘導根系分(fēn)泌有機酸陰離(lí)子(包括檸檬酸、蘋果酸和草酸)是證據最确鑿的機理之一(yī).分(fēn)泌到胞外(wài)的有機酸陰離(lí)子可以通過螯合作用解除鋁毒.編碼鋁誘導檸檬酸和蘋果酸陰離(lí)子分(fēn)泌的轉運蛋白(bái)基因已被鑒定.同時,衆多證據表明這些基因的表達調控與植物(wù)耐鋁性密切相關.本文概述了近年來植物(wù)耐鋁機理,特别是鋁誘導植物(wù)根系分(fēn)泌有機酸陰離(lí)子的生(shēng)理機制的研究進展.重點總結了編碼有機酸轉運蛋白(bái)基因的鑒定,以及對這些基因表達調控的理解.本文也對調控有機酸轉運蛋白(bái)基因表達的可能的信号通路作了讨論,并提出了該領域的研究展望.

關鍵詞組：酸性土壤;鋁毒;表達調控;有機酸陰離(lí)子;轉運蛋白(bái)

Bacterial degradation of anthraquinone dyes

Hai-Hong Li, Yang-Tao Wang, Yang Wang, Hai-Xia Wang, Kai-Kai Sun, Zhen-Mei Lu

DOI: 10.1631/jzus.B1900165 Downloaded: 2327 Clicked: 2449 Cited: 0 Commented: 0(p.528-540) <Full Text> <PPT> 1600

Chinese summary <21> 細菌降解蒽醌染料研究進展

概要:本文綜述了近年來細菌降解蒽醌染料的研究進展及機理,以期爲蒽醌染料廢水的實際處理提供理論依據.目前主要利用物(wù)理、化學及生(shēng)物(wù)法處理工(gōng)業印染廢水中(zhōng)的各種染料.與前兩者相比,生(shēng)物(wù)法具有經濟且環保的特點.本文以蒽醌染料的分(fēn)類及結構爲基礎,總結近年來已報道的蒽醌染料高效降解細菌的多樣性;初步探讨細菌吸附、降解蒽醌染料的機理與主要影響因素;根據目前的研究進展及存在問題,提出細菌降解蒽醌染料的研究方向.

關鍵詞組：蒽醌染料;細菌降解;降解機理;影響因素