Journal of Zhejiang University

Current Issue: <JZUS-B>

Journal of Zhejiang University-SCIENCE B (Biomedicine & Biotechnology)

ISSNs 1673-1581 (Print); 1862-1783 (Online); CN 33-1356/Q; started in 2005,Monthly.

JZUS-B is an international "Biomedicine & Biotechnology" reviewed-Journal indexed by SCI-E, MEDLINE, PMC, BA, BIOSIS Previews, JST, ZR, CA, SA, AJ, ZM, CABI, CSA, etc., and supported by the National Natural Science Foundation of China. It mainly covers research in Biomedicine, Biochemistry and Biotechnology, etc.

Impact factor: 1.099 (2011), 1.108 (2012), 1.293 (2013), 1.278 (2014), 1.303 (2015), 1.676 (2016), 1.815 (2017), 1.879 (2018).

Journal of Zhejiang University SCIENCE B

ISSN 1673-1581(Print), 1862-1783(Online), Monthly

2016 Vol.17 No.12 P.905-996

<<< CONTENTS >>>

Articles

Frequency and type of inheritable mutations induced by γ rays in rice as revealed by whole genome sequencing

Shan Li, Yun-chao Zheng, Hai-rui Cui, Hao-wei Fu, Qing-yao Shu, Jian-zhong Huang

DOI: 10.1631/jzus.B1600125 Downloaded: 2578 Clicked: 4762 Cited: 0 Commented: 0(p.905-915) <Full Text> <PPT> 1752

Chinese summary <22> 基因組重測序分(fēn)析γ射線誘發水稻可遺傳變異的頻(pín)率與特征

目的：研究γ射線對水稻基因組的誘變效應，明确其誘發突變的類型、分(fēn)布和頻(pín)率。
創新點：首次針對種子繁殖植物(wù)在全基因組範圍及單核苷酸水平上揭示了γ射線誘發可遺傳變異的頻(pín)率與特征。
方法：利用Illumina Hiseq2000對三種γ射線劑量輻照培育的6株水稻（日本晴）M₂植株進行基因組重測序，生(shēng)物(wù)信息學分(fēn)析确定單堿基替換（SBS）和插入缺失（Indel）突變，以及結構變異和拷貝數等變異的頻(pín)率和基因組分(fēn)布。利用Sanger測序、目标片段擴增或定量多聚酶鏈反應（qPCR）對各類突變進行驗證。綜合重測序和驗證結果估算誘發突變頻(pín)率。
結論：結果表明，γ射線既可以誘發單堿基替換，也可以誘發插入缺失突變和結構變異；水稻M₂代植株中(zhōng)的平均突變頻(pín)率達到7.5×10⁻⁶~9.8×10⁻⁶；Indel突變頻(pín)率約爲SBS變異的1/4，而結構變異頻(pín)率更低；SBS和Indel突變随機分(fēn)布在12條染色體(tǐ)上，無明顯的突變熱點。

關鍵詞組：誘變育種；γ射線；突變譜；基因組變異

Nitric oxide induced by polyamines involves antioxidant systems against chilling stress in tomato (Lycopersicon esculentum Mill.) seedling

Qian-nan Diao, Yong-jun Song, Dong-mei Shi, Hong-yan Qi

DOI: 10.1631/jzus.B1600102 Downloaded: 2540 Clicked: 4584 Cited: 3 Commented: 0(p.916-930) <Full Text> <PPT> 1809

Chinese summary <26> 多胺誘導産生(shēng)的一(yī)氧化氮通過影響番茄幼苗抗氧化系統抵禦低溫脅迫

目的：研究多胺（PA）對低溫脅迫下(xià)番茄幼苗中(zhōng)一(yī)氧化氮（NO）産生(shēng)的影響，并探讨NO在PA誘導的耐冷性中(zhōng)發揮的作用。
創新點：在番茄幼苗中(zhōng)證明亞精胺（Spd）對NO産生(shēng)的影響及可能的作用途徑，且此作用與番茄耐低溫性有密切關系。
方法：通過檢測氧合血紅蛋白(bái)（HbO₂）向高鐵血紅蛋白(bái)（metHb）的轉化進行NO含量測定；通過與NO特異性熒光探針（DAF-FM DA）結合檢測NO釋放(fàng)量（圖1和2）。超氧化物(wù)歧化酶（SOD）活性根據其抑制氮藍(lán)四唑（NBT）在光下(xià)的還原作用測定；過氧化物(wù)酶（POD）活性通過測定酶提取液與愈創木酚、過氧化氫（H₂O₂）的混合物(wù)的吸光度确定；過氧化氫酶（CAT）活性根據H₂O₂在240 nm波長下(xià)的降解能力來測定；抗壞血酸過氧化物(wù)酶（APX）活性的測定參照Nakano和Asada（1981）的方法在波長290 nm下(xià)測定（圖6和7）。
結論：本研究的結果顯示，Spd誘導番茄葉片中(zhōng)NO的産生(shēng)可直接通過增加一(yī)氧化氮合酶（NOS）和硝酸還原酶（NR）的活性實現（圖2）。H₂O₂作爲上遊信号能夠刺激NO的生(shēng)成（圖3）。NO通過增加抗氧化酶活性和相關基因的表達來參與Spd誘導的番茄耐冷性（圖6和7）。綜上所述，Spd誘導産生(shēng)的NO在番茄響應低溫脅迫中(zhōng)發揮重要作用。

關鍵詞組：番茄；亞精胺；耐冷性；一(yī)氧化氮；抗氧化酶

Effects of rhizobacteria Paenibacillus polymyxa APEC136 and Bacillus subtilis APEC170 on biocontrol of postharvest pathogens of apple fruits

Young Soo Kim, Kotnala Balaraju, Yongho Jeon

DOI: 10.1631/jzus.B1600117 Downloaded: 2548 Clicked: 4518 Cited: 0 Commented: 0(p.931-940) <Full Text> <PPT> 1606

Chinese summary <22> 多粘類芽孢杆菌APEC136和枯草芽孢杆菌APEC170對蘋果采後病害生(shēng)物(wù)防治的影響

目的：研究APEC136和APEC170對蘋果采後炭疽病和白(bái)腐病的生(shēng)物(wù)防治作用。
方法：選擇APEC136和APEC170兩菌株爲對象，通過16S rRNA序列分(fēn)析進行菌種鑒定；研究不同的培養基、溫度和pH值等條件對APEC136和APEC170生(shēng)長影響；測定其對幾丁質酶，澱粉酶，纖維素酶和蛋白(bái)酶的産量和活性的影響；分(fēn)析其對膠孢炭疽菌（Colletotrichum gloeosporioides）、尖孢炭疽（Colletotrichum acutatum）和葡萄座腔菌（Botryosphaeria dothidea）的菌絲生(shēng)長抑制作用，觀察蘋果采後炭疽病和白(bái)腐病症狀的變化。
結論：16S rRNA序列分(fēn)析結果發現兩個拮抗菌株分(fēn)别爲多粘類芽孢杆菌和枯草芽孢杆菌。在腦心浸液肉湯（BHI）培養基中(zhōng)，這兩個菌株生(shēng)長最快。體(tǐ)外(wài)生(shēng)物(wù)測定表明，在篩選的30株菌株中(zhōng)，APEC136和APEC170對膠孢炭疽菌、尖孢炭疽和葡萄座腔菌的菌絲生(shēng)長的抑制作用最顯著。APEC136和APEC170均減輕了蘋果采後由病原真菌引起的炭疽病和白(bái)腐病症狀。另外(wài)，APEC136增加了澱粉酶和蛋白(bái)酶産量，APEC170增加了幾丁質酶、澱粉酶和蛋白(bái)酶産量，這些可能是其抑制菌絲生(shēng)長的原因。綜上所述，菌株APEC136和APEC170是有效的蘋果采後炭疽病和白(bái)腐病的生(shēng)物(wù)防治劑，可用于野外(wài)條件下(xià)的疾病控制。

關鍵詞組：炭疽病；拮抗活性；生(shēng)物(wù)防治；白(bái)腐病；蘋果

Antioxidant and antidiabetic properties of tartary buckwheat rice flavonoids after in vitro digestion

Tao Bao, Ye Wang, Yu-ting Li, Vemana Gowd, Xin-he Niu, Hai-ying Yang, Li-shui Chen, Wei Chen, Chong-de Sun

DOI: 10.1631/jzus.B1600243 Downloaded: 3166 Clicked: 4617 Cited: 3 Commented: 0(p.941-951) <Full Text> <PPT> 2063

Chinese summary <24> 體(tǐ)外(wài)模拟消化對黑苦荞米黃酮抗氧化及降血糖活性的影響

目的：研究黑苦荞米黃酮模拟消化前後活性成分(fēn)含量變化，以及模拟消化對其抗氧化及降血糖活性的影響。
創新點：采用體(tǐ)外(wài)模拟消化的方法，更加真實地反應消化對黑苦荞米黃酮含量及活性的影響，同時采用體(tǐ)外(wài)抗氧化方法、α-葡萄糖苷酶實驗和HepG2細胞模型，評價其抗氧化和降血糖活性。
方法：本文采用體(tǐ)外(wài)模拟消化的方法，對黑苦荞米黃酮進行模拟消化，使用高效液相色譜（HPLC）檢測其消化前後黃酮物(wù)質含量變化情況（表1和圖1）；通過ABTS、DPPH和FRAP等實驗研究模拟消化對其抗氧化活性的影響（表2和圖2），進一(yī)步檢測其消化前後對細胞活性氧（ROS）産生(shēng)的抑制能力（圖3）；利用α-葡萄糖苷酶活性抑制實驗（圖4）以及細胞葡萄糖消耗和糖原含量實驗（圖5），評價黑苦荞米黃酮模拟消化前後的降血糖活性。
結論：HPLC結果表明，黑苦荞米黃酮中(zhōng)的主要活性物(wù)質爲蘆丁和槲皮苷，經模拟消化後，其活性物(wù)質含量沒有顯著變化。體(tǐ)外(wài)抗氧化實驗ABTS、DPPH和FRAP結果均表明，黑苦荞米黃酮具有抗氧化活性，體(tǐ)外(wài)模拟消化後，其抗氧化活性有所降低；細胞ROS結果表明，黑苦荞米黃酮模拟消化前後均具有較好的ROS抑制活性。進一(yī)步研究表明，黑苦荞米黃酮模拟消化前後對α-葡萄糖苷酶具有較好的抑制能力，同時可以促進細胞對葡萄糖的消耗以及細胞糖原的生(shēng)成，具有較好的降血糖活性。

關鍵詞組：黑苦荞米；黃酮；體(tǐ)外(wài)模拟消化；抗氧化；降血糖

Effects of taurine and housing density on renal function in laying hens

Zi-li Ma, Yang Gao, Hai-tian Ma, Liu-hai Zheng, Bin Dai, Jin-feng Miao, Yuan-shu Zhang

DOI: 10.1631/jzus.B1600014 Downloaded: 2215 Clicked: 4412 Cited: 0 Commented: 0(p.952-964) <Full Text> <PPT> 1537

Chinese summary <23> 日糧中(zhōng)添加牛磺酸對不同飼養方式蛋雞腎髒功能的影響

目的：飼喂牛磺酸和降低飼養密度對蛋雞腎髒功能的影響。
創新點：通過研究日糧中(zhōng)添加牛磺酸對不同飼養方式蛋雞腎髒功能的影響，證實日糧中(zhōng)添加牛磺酸和降低飼養密度均能降低蛋雞腎髒損傷程度。
方法：将15 000隻綠殼蛋雞随機分(fēn)成散養組、籠養低密度組和籠養高密度組，每組又(yòu)分(fēn)成對照組（正常日糧）和實驗組（日糧中(zhōng)添加0.1%牛磺酸）。十五天後，無菌采集血液及腎髒組織，分(fēn)析組織病理學變化、炎症介質水平、氧化及抗氧化水平等。
結論：結果表明，降低飼養密度和日糧中(zhōng)添加牛磺酸可以改善腎髒損傷，促進生(shēng)産，提高蛋雞健康和福利水平。

關鍵詞組：飼養模式；福利；牛磺酸；蛋雞；腎髒損傷

Effects of soybean isoflavone on intestinal antioxidant capacity and cytokines in young piglets fed oxidized fish oil

Lin Huang, Xian-yong Ma, Zong-yong Jiang, You-jun Hu, Chun-tian Zheng, Xue-fen Yang, Li Wang, Kai-guo Gao

DOI: 10.1631/jzus.B1600078 Downloaded: 2457 Clicked: 5050 Cited: 1 Commented: 0(p.965-974) <Full Text> <PPT> 1791

Chinese summary <18> 大(dà)豆異黃酮對飼喂氧化魚油新生(shēng)仔豬腸道抗氧化功能及細胞因子的影響

目的：研究大(dà)豆異黃酮對氧化魚油造成仔豬氧化應激的緩解作用，并初步探讨其作用機制。
創新點：首次在仔豬腸道氧化應激模型中(zhōng)證明大(dà)豆異黃酮可緩解仔豬氧化應激，且此作用與提高其免疫功能相關。
方法：将72頭平均體(tǐ)重約1.8 kg的4日齡杜×（長×大(dà)）三元雜(zá)公豬随機分(fēn)爲3組，每組重複6次，每次重複包括4頭豬：對照組（飼喂50 g/kg新鮮魚油），處理組1（添加50 g/kg氧化魚油）和處理組2（添加50 g/kg氧化魚油+20 mg/kg大(dà)豆異黃酮）；基礎日糧根據NRC（2012）《豬的營養需要量》配制，每3小(xiǎo)時飼喂一(yī)次，記錄每天采食量；實驗期21天結束後，稱重，計算平均日采食量、平均日增重及料重比。用蘇木精-伊紅染色法觀察小(xiǎo)腸形态結構，并計算絨毛高度和隐窩深度，應用南(nán)京建成試劑盒測定腸道中(zhōng)抗氧化酶的活性，應用酶聯免疫吸附測定（ELISA）試劑盒測定細胞炎症相關因子和細胞凋亡相關因子的表達。
結論：飼喂氧化魚油引起新生(shēng)仔豬腸道産生(shēng)氧化應激，引起仔豬生(shēng)長性能下(xià)降、腸道發育受損、細胞凋亡增加及免疫功能失調。而添加大(dà)豆異黃酮能減緩氧化魚油造成的腸道損傷，提高腸道粘膜完整性，提高腸道粘膜細胞抗氧化功能和免疫功能。

關鍵詞組：仔豬；氧化魚油；生(shēng)長性能；大(dà)豆異黃酮；抗氧化功能

Developing a rat model of dilated cardiomyopathy with improved survival

Li-juan Shen, Shu Lu, Yong-hua Zhou, Lan Li, Qing-min Xing, Yong-liang Xu

DOI: 10.1631/jzus.B1600257 Downloaded: 2291 Clicked: 3590 Cited: 0 Commented: 0(p.975-983) <Full Text> <PPT> 1674

Chinese summary <18> 提高擴張型心肌病動物(wù)模型的生(shēng)存率

目的：比較在腹腔注射相同劑量阿黴素（12 mg/kg）下(xià)，不同給藥方案構建擴張型心肌病大(dà)鼠模型的生(shēng)存率。
創新點：首次應用腹腔注射阿黴素1 mg/kg，一(yī)周兩次的方法構建擴張型心肌病大(dà)鼠模型，并與常規的方法進行生(shēng)存率的比較。
方法：将150隻SD雄鼠分(fēn)爲對照組（腹腔注射生(shēng)理鹽水）、Dox 1組（腹腔注射阿黴素1 mg/kg一(yī)周兩次，共六周）和Dox 2組（腹腔注射阿黴素2 mg/kg一(yī)周一(yī)次，共六周）。觀察及比較各組大(dà)鼠的體(tǐ)重、生(shēng)存率、心腔大(dà)小(xiǎo)、pro-BNP、CRP、CREA、AST和Caspase-3 mRNA水平。觀察各組大(dà)鼠心肌病理變化，同時進行¹⁸FDG-PET心肌代謝顯像。
結論：本實驗中(zhōng)結果顯示，Dox 1組和Dox 2組在pro-BNP、Caspase-3 mRNA水平、心肌病理變化及¹⁸FDG-PET心肌代謝顯像上均沒有明顯差異；但Dox 1組的生(shēng)存率是78%，而Dox 2組的生(shēng)存率是52%；同時，Dox 2組大(dà)鼠的血清CREA、AST和CRP水平比Dox 1組明顯升高。綜上所述，腹腔注射阿黴素1 mg/kg一(yī)周兩次的方法在成功構建擴張型心肌病大(dà)鼠模型的同時大(dà)大(dà)提高了存活率。

關鍵詞組：阿黴素；擴張型心肌病；動物(wù)模型；¹⁸FDG-PET

Prognostic significance of regulatory T lymphocytes in patients with hepatocellular carcinoma

Ai-bin Zhang, Yi-gang Qian, Shu-sen Zheng

DOI: 10.1631/jzus.B1600264 Downloaded: 2583 Clicked: 4530 Cited: 2 Commented: 1(p.984-991) <Full Text> <PPT> 1735

Chinese summary <22> 調節性T細胞在肝癌患者中(zhōng)的預後意義

目的：通過系統性文獻檢索和meta分(fēn)析評估調節性T細胞與肝癌患者生(shēng)存時間的相關性。
創新點：針對調節性T細胞在肝癌患者中(zhōng)的預後意義進行系統性文獻綜述和分(fēn)析，進一(yī)步證實其可以作爲預測肝癌預後的指标。
方法：在MEDLINE和Embase數據庫中(zhōng)搜索相關文獻，提取數據并對文獻質量進行評估。有18項研究納入到最後的分(fēn)析，包括的肝癌患者多數爲乙肝病毒感染。利用meta分(fēn)析的方法對相關結果進行合并分(fēn)析。
結論：本實驗證實，腫瘤組織内調節性T細胞與肝癌患者預後顯著相關，調節性T細胞數量高的患者生(shēng)存時間和無瘤生(shēng)存期均較短。同樣，外(wài)周循環調節性T細胞數量與肝癌患者生(shēng)存期也呈負相關。

關鍵詞組：肝細胞肝癌；調節性T細胞；預後

Correspondence

Correspondence: Genome-wide profiling of genetic variation in Agrobacterium-transformed rice plants

Wen-xu Li, San-ling Wu, Yan-hua Liu, Gu-lei Jin, Hai-jun Zhao, Long-jiang Fan, Qing-yao Shu

DOI: 10.1631/jzus.B1600301 Downloaded: 2398 Clicked: 5096 Cited: 1 Commented: 0(p.992-996) <Full Text> <PPT> 1650

Chinese summary <22> 農杆菌介導的水稻轉化植株遺傳變異特征的全基因組分(fēn)析

目的：揭示轉基因水稻全基因組遺傳變異的特征與頻(pín)率。
創新點：通過單核苷酸分(fēn)辨率揭示了農杆菌介導法轉化水稻植株全基因組水平遺傳變異的類型和頻(pín)率以及外(wài)源DNA的整合模式。
方法：應用Illumina Hiseq2000高通量測序技術測定了 5個T0代轉基因水稻株系的基因組序列。結合生(shēng)物(wù)信息學分(fēn)析和聚合酶鏈反應（PCR）擴增，以及Sanger測序，我(wǒ)們檢測和驗證單核苷酸多态性（SNP）和Indel變化類型和數量，轉移DNA（T-DNA）及其載體(tǐ)骨架序列和轉座子整合位點及特征，大(dà)片段的結構變異等遺傳變異。
結論：結果表明，農杆菌介導的水稻遺傳轉化，除T-DNA整合到水稻基因組外(wài)，還存在載體(tǐ)骨架整合現象；每個轉基因水稻基因組的變異（SNP和小(xiǎo)片段的缺失插入）數目爲338-1774，與報道的組培過程中(zhōng)産生(shēng)的變異類似；轉基因水稻基因組僅存在Tos17轉座子數量的變化，未檢測到其他轉座子數目和位置的變化。

關鍵詞組：水稻；遺傳轉化；全基因組；轉移DNA；轉座子