Journal of Zhejiang University

Current Issue: <JZUS-B>

Journal of Zhejiang University-SCIENCE B (Biomedicine & Biotechnology)

ISSNs 1673-1581 (Print); 1862-1783 (Online); CN 33-1356/Q; started in 2005,Monthly.

JZUS-B is an international "Biomedicine & Biotechnology" reviewed-Journal indexed by SCI-E, MEDLINE, PMC, BA, BIOSIS Previews, JST, ZR, CA, SA, AJ, ZM, CABI, CSA, etc., and supported by the National Natural Science Foundation of China. It mainly covers research in Biomedicine, Biochemistry and Biotechnology, etc.

Impact factor: 1.099 (2011), 1.108 (2012), 1.293 (2013), 1.278 (2014), 1.303 (2015), 1.676 (2016), 1.815 (2017), 1.879 (2018).

Journal of Zhejiang University SCIENCE B

ISSN 1673-1581(Print), 1862-1783(Online), Monthly

2014 Vol.15 No.11 P.929-1012

<<< CONTENTS >>>

Articles

Simultaneous determination by UPLC-MS/MS of seven bioactive compounds in rat plasma after oral administration of Ginkgo biloba tablets: application to a pharmacokinetic study

Wen-ping Wang, Na Liu, Qian Kang, Pei-pei Du, Yi Lan, Bo-chen Zhao, Yan-yan Chen, Qing Zhang, Hui Li, Ye-wen Zhang, Qing Wu

DOI: 10.1631/jzus.B1400035 Downloaded: 2945 Clicked: 5832 Cited: 2 Commented: 0(p.929-939) <Full Text> <PPT> 1885

Chinese summary <380> UPLC-MS/MS法測定口服銀杏葉片的大(dà)鼠血漿中(zhōng)七種活性成分(fēn)及藥代動力學研究

建立一(yī)個快速靈敏且具有專屬性的體(tǐ)内分(fēn)析方法用于銀杏葉片的藥代動力學研究。運用超高壓液相色譜-二級質譜連用法（UPLC-MS/MS）進行大(dà)鼠血漿中(zhōng)七種活性成分(fēn)的測定，方法簡單快速，适合于銀杏葉制劑的藥代動力研究。采用液液萃取進行血漿樣品處理，該方法簡單且快速。采用超高壓液相色譜（UPLC）進行七種活性成分(fēn)分(fēn)離(lí)，達到了多種成分(fēn)快速分(fēn)離(lí)的目的。采用二級質譜（MS/MS）進行檢測，優化質譜條件，減小(xiǎo)了内源性幹擾并提高檢測靈敏度。經過專屬性、線性、回收率、基質效應、精密度、準确度和穩定性考察，驗證了該方法的适用性。經驗證，該方法适用于銀杏葉片的藥代動力學研究。液液萃取處理血漿樣品簡單可靠，回收率穩定，無基質效應（表4）。UPLC-MS/MS能夠快速、靈敏、專屬性地分(fēn)析大(dà)鼠血漿七種活性成分(fēn)的血藥濃度（表3和圖3）。該方法适用于銀杏葉片的七種活性成分(fēn)的藥代動力學研究（圖4和5）。

超高壓液相色譜-二級質譜連用法（UPLC-MS/MS）；銀杏葉片；藥代動力學

Essential oil from Zanthoxylum bungeanum Maxim. and its main components used as transdermal penetration enhancers: a comparative study

Yi Lan, Hui Li, Yan-yan Chen, Ye-wen Zhang, Na Liu, Qing Zhang, Qing Wu

DOI: 10.1631/jzus.B1400158 Downloaded: 2717 Clicked: 6290 Cited: 15 Commented: 0(p.940-952) <Full Text> <PPT> 1884

Chinese summary <375> 花椒揮發油與其主要成分(fēn)經皮促透作用的比較研究

比較花椒揮發油與其主要成分(fēn)作爲經皮促透劑的皮膚細胞毒性，對系列不同油水分(fēn)配系數藥物(wù)促透作用特征及其作用機制。選擇系列不同油水分(fēn)配系數中(zhōng)藥活性成分(fēn)簡化并表征中(zhōng)藥制劑中(zhōng)複雜(zá)有效成分(fēn)，對比研究花椒揮發油與其主要成分(fēn)的經皮促透作用特征差異。利用表皮角質形成細胞（HaCaT）和真皮成纖維細胞（CCC-ESF-1）測定其皮膚細胞毒性，選擇系列不同油水分(fēn)配系數中(zhōng)藥活性成分(fēn)作爲模型藥物(wù)測定花椒揮發油與其主要成分(fēn)的經皮促透作用特征差異，并在此基礎上采用傅利葉變換紅外(wài)光譜（FTIR）等研究其促透作用機制。花椒揮發油相對于其單一(yī)組成成分(fēn)具有更好的經皮促透效果。

花椒揮發油；檸檬烯；促透劑；表皮角質形成細胞（HaCaT）；傅利葉變換紅外(wài)光譜（FTIR）

Temporal changes in soil bacterial and archaeal communities with different fertilizers in tea orchards

Hua Wang, Shao-hui Yang, Jing-ping Yang, Ya-min Lv, Xing Zhao, Ji-liang Pang

DOI: 10.1631/jzus.B1400114 Downloaded: 2593 Clicked: 6472 Cited: 3 Commented: 0(p.953-965) <Full Text> <PPT> 1817

Chinese summary <375> 不同肥料處理下(xià)茶園土壤細菌和古菌群落的時間變化研究

研究化學肥料和有機肥處理條件下(xià)，茶園酸性土壤細菌和古菌群落結構，以及氮素轉化相關功能酶基因豐度的時間變化規律。研究肥料、土壤溫度及土壤含水量對茶園酸性土壤細菌和古菌群落結構，以及氮素轉化相關功能酶基因豐度的影響。應用末端限制性片段長度多态性（T-RFLP）技術分(fēn)析茶園酸性土壤中(zhōng)細菌和古菌群落結構随時間的變化規律，應用熒光定量聚合酶鏈式反應（PCR）技術，研究茶園酸性土壤細菌、古菌、硝化作用功能酶基因（細菌和古菌基因）和細菌反硝化作用功能酶基因（、、和基因）豐度的時間變化規律。茶園土壤細菌和古菌群落結構受到肥料的影響，并随着取樣時間有顯著的變化。細菌、古菌和古菌的基因的豐度在7月份最小(xiǎo)，而細菌的基因和反硝化作用功能酶基因（除基因）的豐度在9月份最小(xiǎo)。有機肥處理增加了細菌、古菌和氮素轉化相關功能酶基因的豐度，但化學肥料的施用對菌群及功能酶基因豐度的影響較小(xiǎo)。土壤溫度顯著影響了土壤細菌和古菌的群落結構。土壤含水量與細菌反硝化作用功能酶基因有顯著的相關性。土壤有機碳含量與細菌、古菌及功能酶基因豐度之間有顯著的相關性。

茶園；時間變化；肥料；細菌和古菌群落；氮素轉化相關功能酶基因

Designing a SCAR molecular marker for monitoring Trichoderma cf. harzianum in experimental communities

Gabriel Pérez, Valentina Verdejo, Clarissa Gondim-Porto, Julieta Orlando, Margarita Carú

DOI: 10.1631/jzus.B1400063 Downloaded: 2570 Clicked: 6881 Cited: 2 Commented: 0(p.966-978) <Full Text> <PPT> 1772

Chinese summary <371> SCAR分(fēn)子标記監測菌群中(zhōng)的哈茨木黴

開(kāi)發具有種屬特異性序列特征性擴增區域（SCAR）标記物(wù)來監測哈茨木黴在其入侵的試驗菌群中(zhōng)的定殖和生(shēng)長，爲哈茨木黴應用于生(shēng)物(wù)防治等生(shēng)态和生(shēng)物(wù)技術中(zhōng)提供支撐。多種木黴屬真菌能與各種微觀和宏觀的生(shēng)物(wù)有機體(tǐ)建立相互作用。利用這些相互作用，木黴可做爲原生(shēng)種群的入侵物(wù)種而用于生(shēng)物(wù)防治。本文通過使用試驗菌群爲研究模型，利用随機擴增多态性DNA（RAPD）技術和序列特征性擴增區域（SCAR）标記物(wù)來監測菌群中(zhōng)哈茨木黴的生(shēng)長狀态。利用随機擴增多态性DNA（RAPD）技術，從16個10聚體(tǐ)引物(wù)進行多态性篩選，其中(zhōng)1個引物(wù)擴增出對應哈茨木黴的條帶。對該條帶進行克隆測序，并設計5個20-23聚體(tǐ)引物(wù)。成功利用引物(wù)對2F2/2R2和2F2/2R3278分(fēn)别特異性地擴增出哈茨木黴BpT10a菌株278 bp和448 bp的DNA片段。同時，用這兩個引物(wù)對14個哈茨木黴菌株和幾種不同的真菌菌株進行特異性對照試驗，也隻成功擴增出哈茨木黴菌株。此外(wài)，使用真菌DNA混合物(wù)和試驗真菌群的DNA爲模闆，采用實時聚合酶鏈式反應（PCR）對引物(wù)對2F2/2R2進行評估。當僅使用100份SCAR标記物(wù)或哈茨木黴僅占整個菌群的0.1%時，仍能檢測出哈茨木黴。本研究所建立的SCAR分(fēn)子标記能有效監測菌群中(zhōng)的哈茨木黴的定殖和生(shēng)長，具有較高特異性、靈敏度和準确度。

哈茨木黴；序列特征性擴增區域（SCAR）；分(fēn)子标記；試驗菌群

Vitreoscilla hemoglobin promotes Salecan production by Agrobacterium sp. ZX09

Yun-mei Chen, Hai-yang Xu, Yang Wang, Jian-fa Zhang, Shi-ming Wang

DOI: 10.1631/jzus.B1400123 Downloaded: 2565 Clicked: 4512 Cited: 1 Commented: 0(p.979-985) <Full Text> <PPT> 1750

Chinese summary <368> 在土壤杆菌ZX09中(zhōng)透明顫菌血紅蛋白(bái)的表達提高索拉膠的産量

提高胞外(wài)多糖索拉膠的産量。透明顫菌血紅蛋白(bái)基因在質粒上表達，不加抗生(shēng)素發酵生(shēng)産索拉膠。将透明顫菌血紅蛋白(bái)基因構建到廣譜質粒pCM158上得到重組質粒pCM158-vgb，重組質粒轉入土壤杆菌ZX09中(zhōng)，使透明顫菌血紅蛋白(bái)在土壤杆菌ZX09中(zhōng)表達。在土壤杆菌ZX09中(zhōng)顫菌血紅蛋白(bái)的表達解決了發酵過程中(zhōng)氧受限的問題，提高了宿主菌的呼吸速率、蔗糖酶活性和黏度，将發酵産物(wù)索拉膠的産量提高了30%。

索拉膠；透明顫菌血紅蛋白(bái)；土壤杆菌ZX09；蔗糖酶；呼吸速率

Positional variation in grain mineral nutrients within a rice panicle and its relation to phytic acid concentration

Da Su, Faisal Sultan, Ning-chun Zhao, Bing-ting Lei, Fu-biao Wang, Gang Pan, Fang-min Cheng

DOI: 10.1631/jzus.B1400157 Downloaded: 2373 Clicked: 5214 Cited: 1 Commented: 0(p.986-996) <Full Text> <PPT> 1798

Chinese summary <370> 水稻穗内不同粒位間的礦質營養變化差異及其與籽粒植酸含量的關系

闡明水稻穗内不同粒位間的主要礦質營養元素和植酸含量差異、粒位分(fēn)布特點及其與品種穗型間的聯系。将水稻品種的穗型變化與稻米營養品質結合起來，從水稻穗粒結構角度，對同一(yī)稻穗内不同籽粒間的主要礦質營養元素與植酸含量差異、粒位分(fēn)布特點及其與水稻品種穗型間的相互關系進行了較系統的探讨分(fēn)析。以典型的直立穗型和彎穗型粳稻品種爲材料，通過對兩類水稻品種在相同栽培條件下(xià)籽粒礦質營養元素和植酸含量的測定分(fēn)析，并依據水稻籽粒在稻穗上的着生(shēng)部位，将同一(yī)稻穗内的不同籽粒劃分(fēn)爲六個粒位，比較分(fēn)析了兩類品種同一(yī)稻穗内不同部位間礦質營養元素和植酸含量的差異變化及其粒位分(fēn)布特點。水稻穗型雖然與品種間的籽粒礦質營養元素和植酸含量高低沒有直接關系，但對其穗内不同籽粒間的主要礦質營養元素和植酸含量存在着較大(dà)影響；與稻穗中(zhōng)下(xià)部的弱勢粒相比，同一(yī)稻穗内着生(shēng)在稻穗上中(zhōng)部的強勢粒通常具有相對較高的鋅、鐵礦質元素含量，而籽粒植酸含量和植酸/鋅（鐵）摩爾比則有所降低，稻米營養品質也相對較好；不同礦質營養元素相比，粒位效應對鐵礦質營養的影響作用要略大(dà)于對鈣和鋅營養元素含量。

水稻穗型；粒位效應；營養品質；礦質元素；植酸

Development of 107 SSR markers from whole genome shotgun sequences of Chinese bayberry (Myrica rubra) and their application in seedling identification

Hui-min Jia, Yu-tong Shen, Yun Jiao, Guo-yun Wang, Xiao Dong, Hui-juan Jia, Fang Du, Sen-miao Liang, Chao-chao Zhou, Wei-hua Mao, Zhong-shan Gao

DOI: 10.1631/jzus.B1400051 Downloaded: 4970 Clicked: 7715 Cited: 4 Commented: 0(p.997-1005) <Full Text> <PPT> 1986

Chinese summary <371> 基于楊梅基因組鳥槍法測序開(kāi)發的107個SSR标記及其在品系鑒定中(zhōng)應用

開(kāi)發多态性高的基因組簡單重複序列（SSR）标記，爲楊梅遺傳多樣性、遺傳圖譜構建及品種鑒定相關研究奠定基礎。從楊梅全基因組鳥槍法測序數據中(zhōng)新開(kāi)發了107個SSR标記，并應用于品種間遺傳多樣性分(fēn)析及品系鑒定。應用生(shēng)物(wù)信息學軟件從基因組測序數據中(zhōng)搜索SSR位點并設計相應引物(wù)，添加通用的M13尾巴和熒光标識篩選多态性高的SSR标記。開(kāi)發的107個基因組SSR标記可以廣泛應用于楊梅種質資(zī)源和遺傳育種研究，鑒定出三個楊梅新品系。

楊梅；簡單序列重複（SSR）标記；遺傳多樣性

A mutation of Aspergillus niger for hyper-production of citric acid from corn meal hydrolysate in a bioreactor

Wei Hu, Jing Liu, Ji-hong Chen, Shu-yang Wang, Dong Lu, Qing-hua Wu, Wen-jian Li

DOI: 10.1631/jzus.B1400132 Downloaded: 2690 Clicked: 4967 Cited: 9 Commented: 0(p.1006-1010) <Full Text> <PPT> 2145

Chinese summary <376> 高産檸檬酸突變菌株以玉米粉爲原料的生(shēng)物(wù)反應器擴大(dà)生(shēng)産研究

研究高産黑曲黴突變菌株以玉米粉爲原料的生(shēng)物(wù)反應器擴大(dà)發酵，以期獲得适合于工(gōng)業化生(shēng)産檸檬酸的發酵工(gōng)藝。以玉米粉爲原料，系統地研究了篩選得到的高産菌株在50 L生(shēng)物(wù)反應器中(zhōng)不同糖濃度發酵生(shēng)産檸檬酸的特性，最終優化出适合于工(gōng)業化生(shēng)産檸檬酸的發酵工(gōng)藝。（1）利用澱粉酶對粉碎後的玉米進行液化，然後過濾，最終得上清液；（2）以50 L生(shēng)物(wù)反應器作爲發酵設備，對篩選得到的高産檸檬酸菌株進行擴大(dà)培養；（3）通過測定不同培養時期中(zhōng)積累的檸檬酸含量和剩餘的殘總糖，最終優化出高效率生(shēng)産檸檬酸的發酵工(gōng)藝。以不同糖濃度的液化玉米粉上清液作爲碳源，突變菌株H4002能積累177.7~196.0 g/L的檸檬酸，效率能達到2.96~3.27 g/(L∙h)，尤其當糖濃度爲210 g/L，H4002菌株表現出最佳的檸檬酸生(shēng)産水平，如檸檬酸積累187.5 g/L，生(shēng)産效率達3.13 g/(L∙h)。上述結果說明了突變菌株H4002擁有快速生(shēng)産檸檬酸的能力。

突變；檸檬酸生(shēng)産；玉米粉液化液；黑曲黴

Erratum

Erratum to: Identification of a novel mutation in a Chinese family with Nance-Horan syndrome by whole exome sequencing

Nan Hong, Yan-hua Chen, Chen Xie, Bai-sheng Xu, Hui Huang, Xin Li, Yue-qing Yang, Ying-ping Huang, Jian-lian Deng, Ming Qi, Yang-shun Gu

DOI: 10.1631/jzus.B13e0321 Downloaded: 2148 Clicked: 5227 Cited: 0 Commented: 0(p.1011-1011) <Full Text>

Retraction Note

Retraction Note to: Characterization of cancer stem-like cells in the side population cells of human gastric cancer cell line MKN-45

Hai-hong Zhang, Ai-zhen Cai, Xue-ming Wei, Li Ding, Feng-zhi Li, Ai-ming Zheng, Da-jiang Dai, Rong-rong Huang, Hou-jun Cao, Hai-yang Zhou, Jian-mei Wang, Xue-jing Wang, Wei Shi, Heng Zhu, Xiao-ying Yuan, Lin Chen

DOI: 10.1631/jzus.B12r0102 Downloaded: 2142 Clicked: 5115 Cited: 0 Commented: 0(p.1012-1012) <Full Text>